代谢组学FAQ汇总
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• 请问一下脱分支和未脱分支的GPC处理有啥区别呀 能请教一下脱分支和未脱分支淀粉的区别吗
在凝胶渗透色谱(GPC,Gel Permeation Chromatography)或尺寸排阻色谱(SEC,Size Exclusion Chromatography)的分析过程中,"脱分支"(debranching)是指去除聚合物(例如多糖或者多肽)分子上的分支,使其成为直链的过程。这
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代谢组学是一门研究生物体内代谢物的组成、结构和动态变化的学科。代谢组学的一级数据分析主要包括以下几个步骤: 1.数据预处理:首先需要对原始数据进行预处理,包括基线校正、噪声去除、数据缩放等操作,以提高数据质量。这一步骤对于后续的数据分析至关重要,因为它可以消除实验过程中
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代谢组学是研究所有代谢物的学科,这包括小分子化合物如氨基酸,核苷酸,糖,脂肪酸,以及这些小分子如何通过代谢途径进行相互转化。代谢组学数据的分析通常包括多个级别的处理,一级数据(或称为原始数据)是直接从仪器中获得的,但分析通常不仅限于一级数据。 一级数据通常包含大量的噪音
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如果发现一个不符合规律的差异代谢物,首先我们需要确保实验设计是合理的,数据收集和处理过程中没有出现错误。可以检查实验组和对照组的设置、样本的收集和储存、仪器的校准和操作等。如果发现问题,需要对实验进行修正并重新收集数据。 接下来,应查阅相关文献和数据库,确定这种代谢物是
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蔗糖(sucrose)是一种二糖,由一个葡萄糖(glucose)分子和一个果糖(fructose)分子通过糖苷键连接在一起。蔗糖的分解通常通过以下两种主要方法: 1.酶解法:最常见的是用蔗糖酶(invertase或sucrase)进行水解。蔗糖酶可以催化蔗糖分解成葡萄糖
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在进行OPLS-DA分析时,置换验证是确保模型的有效性并避免过拟合而进行一种常用的模型验证方法。在置换验证中,会随机改变样本的类别标签,然后重新训练模型并计算模型的预测能力。理论上,如果模型是有效的,那么在正确的类别标签下,模型的预测能力应该明显优于随机标签。 在
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• 老师你好我想问一下,做PK的时候组织匀浆的匀浆介质不小心用成了葡萄糖,匀浆液用于检测小分子化合物,会不会对最后的结果影响很大啊
药代动力学的研究过程中,组织匀浆目的是将组织样本转化为匀质的液体形式,以便于进行后续的化学或生物学分析。组织匀浆通常使用无机盐的缓冲液(例如磷酸盐缓冲液,PBS)或Tris-HCl缓冲溶液等。这样的缓冲液可以在保持pH稳定的同时不会干扰实验。 如果你不小心将匀浆介质用成
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代谢通路的每个步骤都由一个或多个酶催化,每个酶都有一个具体的功能和在代谢过程中的特定位置。要确定代谢通路中的关键酶,你可以从以下几个方面出发: 1.理解代谢通路:首先,你需要对整个代谢通路有全面的理解,包括每个步骤以及每个步骤所需要的酶。 2.确定通路中的关键步骤
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• PLS-DA_OPLS-DA二维图:opls-da的载荷图怎么分析呢?
OPLS-DA(正交偏最小二乘判别分析)是一种多元统计分析方法,用于挖掘大量数据中的重要信息。它主要应用于高通量数据的分析,如代谢组学、蛋白质组学等。 在OPLS-DA分析中,载荷图(Loading plot)是一个非常重要的工具。载荷图能够帮助我们理解模型中每个变量的
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• 制作组织匀浆的时候带有血液,制作出来的匀浆液用于检测药物中的小分子,结果会被影响吗
药物在体内的代谢和分布会受到多种生物学因素的影响,包括组织类型、血液供应情况以及药物在血液和组织之间的转移速度等。因此,如果你在制作组织匀浆时混入了血液,可能会影响你的分析结果。 具体来说,血液中可能含有大量的药物或其代谢物,这可能会使你的测量结果高于实际的组织药物水
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