代谢组学FAQ汇总

• • 用多糖做cck8要先灭菌吗？自己冻干的多糖如何灭菌，能过滤膜或者高压吗？

  先来说第一个问题，关于灭菌的必要性，我们需要明确的是在进行细胞实验时，是需要严格灭菌的，以防止可能存在的细菌或其他微生物的污染。CCK-8实验也不例外。 过滤灭菌和高压灭菌都是常用的多糖灭菌方法，它们各自也有不同之处： • 过滤灭菌：适用于溶液型的多糖。如果多糖溶液的粘度不是特别高，并且

• • 请教一下怎么分析非靶代谢组学结果

  分析非靶代谢组学(non-targeted metabolomics)结果是一个复杂的过程，涉及一系列生物信息学步骤： 1. 数据预处理 • 数据清洗：删除噪声和无关的信息。 • 峰值检测和对齐：检测代谢物的峰值，并在不同样品之间对其进行对齐。 • 归一化和标准化：消除由于实验条件或仪器

• • 肝脏代谢组学取材动物太多，不好分装取材。能统一用液氮冻速后转移到-80摄氏度解冻，再分装吗

  在进行肝脏代谢组学研究时，反复冻融过程确实可能会对样品产生影响。因为反复的冻融过程可能引发样品中的代谢酶活性改变，同时代谢物可能被氧化或降解，导致代谢物的组成和浓度因此发生变化而影响到后续的液相色谱-质谱（LC-MS）分析结果。所以为了避免反复冻融，会将样品进行分装，尽量避免外界环境因素

• • 多糖的提取纯化过程中，溶液较多用什么浓缩方式比较好

  在多糖的提取纯化过程中，如果溶液较多，可以考虑使用以下浓缩方式： 1.滤过浓缩：通过合适的滤膜或滤纸，将多糖溶液经过滤，去除大分子物质和杂质，得到较为纯净的滤液。然后将滤液放置在适当的条件下，如降低温度或减压，使溶剂逐渐蒸发，从而实现浓缩。 2.膜分离浓缩：利用半透膜的分离特性，将多糖

• • 想问代谢组学动物一般是做5个平行吗？3个可不可以啊

  在做代谢组学研究时，进行平行实验有助于评估实验的重复性和稳定性，从而减少由实验误差引起的影响，同时增加对所得数据的可靠性。为了确保准确性和可重复性研究人员通常会进行多次独立的平行实验。 在科学研究中，通常是选择3个生物学重复，也是普遍被认可和接受的。如果条件允许，当然也可以选择更多的生

• • 请问有真菌细胞壁多糖提取的具体方法吗

  真菌细胞壁多糖提取的过程大致包括菌种培养和收集、细胞壁分离、细胞壁多糖提取、多糖纯化这几个步骤，不同种类的真菌，可能需要一些特殊的处理步骤，以确保多糖的完整提取。这里我们以一种常见的真菌——酵母菌为例，详细介绍这个流程 ： 1. 真菌培养和收集：选择合适的酵母菌种进行培养。可以使用液体

• • LC/MS 是如何进行MS1 和MS2 检测的？

  LC-MS是液相色谱-质谱联用的技术，它将液相色谱与质谱相结合，以实现对复杂样品的定性和定量分析。在LC-MS中，MS1和MS2检测分别对应一级质谱（MS1）和二级质谱（MS2）分析。以下是LC-MS进行MS1和MS2检测的过程： 1、液相色谱分离：LC-MS的第一步是

• • 多糖过DEAE离子交换层析前，用降低黏度的方法改善过滤效果和速度时盐缓冲液用什么？多离心几次但不抽滤对填料影响大吗？影响可逆吗？

    在进行DEAE离子交换层析之前，为了改善多糖溶液的过滤效果和速度，可以使用一些适当的盐类缓冲液来降低多糖溶液的粘度。常用的盐类缓冲液包括磷酸盐缓冲液（PBS），Tris缓冲液等。这些盐类缓冲液可以通过增加溶液的离子强度，从而降低多糖溶液的粘度。需要注意的是，选择的盐类缓冲液应该与后续的

• • 1.甲酸生成量什么时候测定？2.Smith降解得到的醋酸钠如何除？不除是否影响GC测定？加硼氢化钠和三氟乙酸水解的顺序能不能变？

  很高兴回答您的这个问题，咱一个一个来哈，第一个问题，关于多糖结构解析中高碘酸氧化和Smith降解过程中甲酸生成量的测定，根据已有的文献和实验经验，我建议在高碘酸氧化完成后、加入乙二醇前测定甲酸生成量。这是因为在高碘酸氧化过程中，糖单元的醇基被氧化生成甲酸。在加入乙二醇之前测定甲酸的生成量，

• • 短链脂肪酸用于小鼠疾病改善治疗上，用多少剂量比较合适？文献里盐溶液比如丙酸盐 丙酸 丙酸酯是一个东西吗

    短链脂肪酸(Short Chain Fatty Acids, SCFAs)主要包括醋酸(acetate)、丙酸(propionate)和丁酸(butyrate),是肠道微生物群发酵膳食纤维的主要产物,对于肠道健康和全身代谢都有重要作用。然而,要确定在小鼠模型中使用短链脂肪酸的合适剂量,