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靶向蛋白质组学（Targeted Proteomics）近年来在生物标志物验证、疾病机制研究和转化医学等领域中发挥着越来越重要的作用。相较于探索型蛋白质组学，靶向方法更强调定量准确性、检测灵敏度和数据重复性，但在实际应用过程中，仍面临诸多技术挑战，例如低丰度蛋白检测难、方法标准化不足、数据重
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随着蛋白质组学技术的持续进步，研究重心正逐步从“发现型”（Discovery）方法向“靶向型”（Targeted）策略过渡。靶向蛋白质组学，尤其是多反应监测（Multiple Reaction Monitoring, MRM/SRM）与并行反应监测（Parallel Reaction Mon
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在复杂生物样本中，蛋白质的丰度跨度可高达百万倍（10⁶）。许多具有重要生物学功能的蛋白——如激素受体、转录因子、信号分子和早期疾病标志物——通常属于低丰度类别。尽管这些蛋白在生命活动中扮演关键角色，但由于其丰度低、背景复杂，传统的发现型蛋白质组学方法（如DDA）往往难以稳定检测。靶向蛋白质组
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在蛋白表达系统中，即使来源于同一基因，所产生的蛋白质也可能因剪接变异、翻译起始差异、翻译后修饰或降解途径不同，形成多个结构相似但功能各异的蛋白质异构体（protein isoforms）。这些异构体广泛存在于天然蛋白中，尤其在抗体药物、融合蛋白及重组酶等生物制品开发过程中，其微小的结构差异可
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在现代蛋白质组学研究中，如何选择适当的质谱策略，直接影响数据的深度、准确性以及研究成果的可转化潜力。研究初期通常需要开展广覆盖的探索性分析，此时可选用发现型蛋白质组学（Discovery Proteomics，又称“散弹枪法”）；而在候选靶点筛选完成后，研究重点将转向高特异性、高重复性的验证
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在现代蛋白质组学研究中，DDA、DIA 和 PRM 等数据依赖或靶向采集策略已广泛用于揭示蛋白的表达谱和丰度变化。然而，这些方法更多侧重于蛋白质的“存在”与“数量”，难以直接反映蛋白质的功能状态，例如酶活性、药物结合位点或构象变化等生物学特征。为弥补这一空白，化学蛋白质组学（Chemical
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在疾病早筛、生物标志物验证及药物靶点发现等研究中，低丰度蛋白的精准检测一直是蛋白质组学领域的核心挑战。并行反应监测（Parallel Reaction Monitoring, PRM）技术，凭借其出色的定量准确性和特异性，正在成为靶向蛋白质组学研究的主流策略。通过系统优化PRM策略，科学家们
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选择反应监测质谱是一种基于串联质谱的高灵敏度、定量精准的分析技术，广泛应用于蛋白质组学、代谢组学、药物动力学和环境科学等领域。该方法利用串联质谱的高选择性特点，通过精确筛选目标分子的母离子和特征子离子实现高特异性的靶向检测。相较于传统的全扫描模式，选择反应监测质谱可以有效减少复杂背景信号的干
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单反应监测质谱法是广泛应用于蛋白质组学研究中的质谱技术。单反应监测质谱法的发展历史可追溯至20世纪中叶，随着质谱技术的发展，该方法逐渐成熟。目前，该技术已成为许多实验室的常规工具，为科学研究提供了强有力的支持。其具体应用场景涵盖了生物医学研究、药物代谢研究、环境监测以及食品安全检测等多个领域
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• 使用 Proteome Discoverer 进行无标记定量分析
“使用 Proteome Discoverer 进行无标记定量分析”是当前蛋白质组学研究中常用且高效的定量分析策略之一。该方法指的是在不引入稳定同位素或化学标签的前提下，直接通过质谱仪检测不同样本中蛋白质或肽段的信号强度来实现相对定量。作为一种基于质谱信号强度比较的策略，“使用 Proteo
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