如何利用靶向蛋白质组学精准检测低丰度蛋白？

在复杂生物样本中，蛋白质的丰度跨度可高达百万倍（10⁶）。许多具有重要生物学功能的蛋白——如激素受体、转录因子、信号分子和早期疾病标志物——通常属于低丰度类别。尽管这些蛋白在生命活动中扮演关键角色，但由于其丰度低、背景复杂，传统的发现型蛋白质组学方法（如DDA）往往难以稳定检测。靶向蛋白质组学（Targeted Proteomics）通过预设目标与高选择性扫描路径，成为解决低丰度蛋白检测难题的重要技术手段。

 

一、靶向蛋白质组学如何突破“动态范围瓶颈”

1、MRM与PRM的定量优势

靶向蛋白质组学采用预设目标肽段和离子对，有选择性地采集信号并进行多次累加，提高信噪比与检测灵敏度。

（1）MRM（Multiple Reaction Monitoring）基于三重四极杆，灵敏度高、背景噪音低，适用于血清、尿液等高背景样本。

（2）PRM（Parallel Reaction Monitoring）常搭配Orbitrap平台，在特异性方面优于MRM，能够识别同分异肽并提升定量准确性。

 

二、精准检测低丰度蛋白的关键技术策略

1、样本预处理与富集：打好“前站基础”

（1）免疫富集（SISCAPA）：用抗体富集特定肽段，提高目标/背景比例。

（2）脱盐与高pH反相分级：减少复杂性，避免高丰度蛋白遮蔽信号。

百泰派克在靶向项目中可根据目标蛋白特性，定制免疫亲和层析与高选择性裂解流程，实现样本处理与下游质谱检测的精准耦合。

 

2、优化肽段选择与方法开发

选取无翻译后修饰、易离子化、无异构肽干扰的特征肽段。精调碰撞能量、保留时间窗口、离子通道选择等参数，实现每一个肽段的最优监测状态。

 

三、从相对到绝对：借助内标实现高标准定量

靶向蛋白质组学不仅能进行相对定量，还可借助稳定同位素标记肽（SIS peptides）实现绝对定量。该策略可提供准确的蛋白浓度信息，是临床转化研究的重要工具。

 

百泰派克支持基于SIS内标的靶向定量方案开发，适用于肿瘤、代谢、免疫等多类生物标志物研究。

 

低丰度蛋白的精准检测不仅是技术挑战，更是推动精准医学发展的关键一环。靶向蛋白质组学正以其高选择性、高重现性与强可转化性，为生物标志物开发、药效评估与临床研究提供坚实支持。在百泰派克，我们专注于每一份样本中“微弱但关键的信号”，用专业平台与优化流程，助力您深入探索蛋白质组“深海”中的每一位成员。

 

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