资源中心

• • 蛋白质测序 Q&A

  Q1: 蛋白质测序需要保持蛋白活性吗？A1: 不需要。蛋白质测序关注的是氨基酸序列信息，而非蛋白的生物学功能。因此，无论采用Edman降解法还是质谱法，测序过程中蛋白是否具有活性都不会影响序列结果。实际上，大多数测序流程（如还原、烷基化、酶切或电离）本身就会破坏蛋白活性结构。因此，样品只需结

• • PRM蛋白质组学的数据处理流程

  PRM（Parallel Reaction Monitoring）作为靶向蛋白质组学的重要工具，具备高特异性、高灵敏度和优异的定量重现性，广泛应用于生物标志物验证、机制研究和临床样本定量分析。然而，高质量PRM数据的获取不仅依赖于质谱平台与实验流程的优化，更离不开标准化、严谨的数据处理策略。

• • 靶向蛋白定量：PRM技术如何在多肽水平实现精准分析？

  蛋白质组学研究中，如何对感兴趣蛋白进行准确、可重复的定量分析，是疾病机制解析、药物靶点确认及临床转化研究的关键需求。而由于蛋白质复杂性及其表达水平的高度动态范围，直接进行蛋白质层面定量往往面临巨大挑战。因此，多肽层面的定量策略成为主流路径。PRM技术（Parallel Reaction Mo

• • PRM技术如何帮助分析低丰度蛋白质？

  蛋白质组学研究与临床转化应用中，低丰度蛋白质的定量检测始终是技术瓶颈。这类蛋白虽然表达水平极低，却往往具有极高的生物学意义，例如炎症因子、细胞因子、转录因子或疾病早期标志物。DDA（Data Dependent Acquisition）模式受限于采集深度和动态范围，难以稳定检测这些低丰度靶标

• • 基于PRM的血浆样本靶向蛋白定量分析

  血浆是蛋白质组学研究中最具临床转化价值的样本类型之一，因其来源广泛、获取便捷且包含丰富的系统性生物学信息。然而，血浆中蛋白质浓度动态范围可达10^10级别，高丰度蛋白（如白蛋白、免疫球蛋白）占据总蛋白质质量的90%以上，使得低丰度蛋白质——尤其是潜在的疾病标志物——难以被准确识别。（Para

• • PRM技术在低丰度蛋白质定量中的优势与挑战

  在蛋白质组学研究中，低丰度蛋白质的精准定量对于疾病早期标志物发现、药物靶点验证以及复杂信号通路解析至关重要。然而，常规数据依赖采集（DDA）方法在面对复杂样本背景和极低丰度目标分子的情况下，往往存在检测灵敏度不足、重现性差的问题。近年来，PRM（Parallel Reaction Monit

• • 如何提升鸟枪法蛋白质组学的定量精度？

  鸟枪法蛋白质组学（Shotgun Proteomics）广泛应用于生命科学研究，用于系统解析复杂样本中的蛋白质组成及其丰度变化。尽管其通量高、覆盖广，但在实际操作中，定量精度常受到多环节干扰，影响数据的重现性与生物学解释力。本文从样本制备、质谱采集、数据分析三大维度，系统梳理提高定量精度的关

• • iTRAQ/TMT如何提升鸟枪法定量效率？

  在蛋白质组学研究中，鸟枪法（Shotgun Proteomics）因其覆盖范围广、检测能力强，被广泛应用于复杂样本分析。然而，该方法在多样本定量时仍面临重复性差、通量有限、分析效率低等问题。iTRAQ（Isobaric Tags for Relative and Absolute Quant

• • 鸟枪法如何精准鉴定膜蛋白与低丰度蛋白？

  膜蛋白和低丰度蛋白在细胞通讯、信号转导、物质转运等生命活动中具有核心功能。由于其疏水性强、表达量低、稳定性差，导致在常规蛋白质组学分析中难以准确识别。近年来，鸟枪法（Shotgun Proteomics）通过质谱平台升级与流程优化，正在突破这些识别瓶颈，为膜蛋白与低丰度蛋白研究打开新局面。

• • 鸟枪法蛋白质鉴定常用的数据采集模式：DDA详解

  在蛋白质组学中，鸟枪法（Shotgun Proteomics）依托高通量质谱分析技术，成为主流的全蛋白质组定性手段。其中，数据依赖采集（Data-Dependent Acquisition, DDA）是最早被广泛采用的采集模式，至今仍在新蛋白鉴定和探索性研究中发挥核心作用。本文将系统解析DD