质谱是如何完成肽段序列鉴定的?
质谱完成肽段序列鉴定的原理及过程
1.样品准备与前处理:
蛋白样品首先经过降解,如酶切,得到一系列肽段。
这些肽段经过清洁和富集,为后续的质谱分析做好准备。
2.离子化过程:
肽段在质谱仪中首先被离子化,常用的离子化技术有电喷雾离子化(ESI)和激光解吸/电离(MALDI)。
3.肽段的质量测定:
离子化后的肽段进入质量分析器,例如飞行时间质谱仪(TOF)或离子阱质谱仪,测定其准确的质量或者质量/电荷比。
4.碎片化:
肽段离子在第一次质量测定后,可以在碰撞细胞中与碰撞气体如氮气或稀有气体碰撞产生碎片离子。这一过程称为碰撞诱导解离(CID)。
5.碎片的质量测定:
碎片离子的质量/电荷比被测定,这些碎片信息用于推测原始肽段的氨基酸序列。
6.数据分析和肽段序列鉴定:
利用质谱数据分析软件,如Mascot、SEQUEST等,将实验得到的肽段和碎片信息与蛋白质数据库进行匹配,得到肽段的氨基酸序列。
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