蛋白分析FAQ汇总

• • DIA做交替采集时，是先把所有窗口的一级全采完，再到高碰撞能去采所有窗口的二级，还是一级二级，一级二级....这样采集呢？

  在数据独立采集的过程中，通常是先采集所有设定窗口的一级质谱（MS1），然后再采集所有窗口的二级质谱（MS2）。这个过程是按照窗口依次进行的，而不是交替进行一级和二级质谱的采集： 具体来说，流程通常是这样的： 1.一级质谱采集： 首先，进行一级质谱的全扫描，覆盖整个质量范围。 2.二级质

• • GC-MS前对样品进行甲基化和糖醛酸还原的操作方法

  在使用气相色谱-质谱联用（GC-MS）进行糖苷键检测之前，对样品进行甲基化和糖醛酸还原是重要的步骤。甲基化是用来保护糖苷键不在随后的分析中被破坏。它通过替换糖分子中的羟基（-OH）为甲基（-CH3），增加了分子的稳定性。糖醛酸（如葡萄糖醛酸）在GC-MS分析中可能不稳定，因此需要将其还原为对

• • 请问对样品溶解的缓冲液有什么要求吗？10mM Tris可以吗？

  对于样品溶解的缓冲液，重要的是确保它适合您的实验需求。10 mM Tris缓冲液通常是一个良好的选择，因为它提供稳定的pH环境并且对大多数生物分子是温和的。然而，也需要考虑以下因素： 1.pH值： 确保Tris缓冲液的pH适合您的样品。Tris在pH 7.0-9.0范围内效果最佳。 2.

• • DIA怎么做到交替采集？是先全扫描打一级图谱，再将一级全扫描范围分为若干窗口，最后循环对每个窗口所有离子进行选择、碎裂和检测吗？

  是的，您对数据独立采集（Data Independent Acquisition, DIA）的基本原理理解得很准确。DIA通常通过以下步骤实现高低碰撞能量的交替采集： 1.全扫描一级质谱图： 首先进行一级质谱的全扫描，以获得样品中所有物质的m/z（质荷比）信息。这一步不涉及碎片化，而是用于

• • 请问GC-MS检测糖苷键结构，要怎么解析啊

  使用气相色谱-质谱联用（GC-MS）分析糖苷键结构时，结果的解析主要依赖于质谱图谱的分析。下面是进行结果解析时的一些关键步骤： 1.GC图谱峰的分析： 首先，需要识别GC图谱上的峰，这些峰代表不同的化合物。每个峰对应一个质谱图，显示了该化合物的质量分布。 2.质谱图的详细分析 分子离子

• • SDS-PAGE蛋白质纯度分析，请问怎么分析条带

  1.条带的清晰度和完整性： 首先观察每个条带的清晰度和是否完整。如果条带模糊或有拖尾现象，可能表示样品中含有杂质。 2.条带的数量： 一个泳道出现多个条带可能表示样品中含有多种蛋白质。如果目标是单一蛋白质，应该只出现一个清晰的条带。 3.背景的干净程度： 背景的干净程度也是判断纯度的一个

• • 蛋白质打LC-MS的参数条件一般怎么设置

  蛋白质的液相色谱-质谱联用（LC-MS）分析时，参数设置取决于样品特性和分析目的。常见的参数设置如下，可以供您参考： 1.色谱条件： 柱子类型：C18反相色谱柱。柱长一般在15-25 cm，内径2.1 mm，粒径3-5 µm。 流动相：A相：水+0.1%甲酸或三氟乙酸。B相：

• • 蛋白除盐柱一般用什么样的呀

  蛋白除盐柱主要用于蛋白质样品的除盐和缓冲液交换。这些柱子一般包含了分子筛介质，如凝胶过滤介质，用于分离蛋白质和小分子如盐。常见的蛋白除盐柱品牌包括GE Healthcare的PD-10柱，Thermo Fisher的Zeba柱等。使用时，样品通过柱子，蛋白质由于其较大的分子量被保留，而小分子

• • 蛋白复溶用的是三乙基碳酸氢铵，还是四乙基溴化铵呀？

  蛋白复溶通常使用三乙基碳酸氢铵（TEAC），而不是四乙基溴化铵。三乙基碳酸氢铵作为一种温和的离子液体，能够有效地溶解蛋白质而不破坏其结构。 百泰派克生物科技——生物制品表征，多组学生物质谱检测优质服务商 相关服务： 蛋白质质谱鉴定 蛋白分子量测定 蛋白测序 蛋白质

• • 想问一下sumo的一般实验设计和思路是什么呢，如果做WB应该选择什么样的抗体呢？

  SUMO化分析主要关注蛋白质的SUMO修饰，这是一种转录后修饰过程，涉及将小分子蛋白SUMO（Small Ubiquitin-like Modifier）共价结合到靶蛋白上。实验设计和思路一般包括以下几个步骤： 1.目标蛋白的选择： 首先确定你想研究的目标蛋白质。这个蛋白质