DIA怎么做到交替采集？是先全扫描打一级图谱，再将一级全扫描范围分为若干窗口，最后循环对每个窗口所有离子进行选择、碎裂和检测吗？
- 在每个质量窗口，采用较低的碰撞能量进行一级质谱采集，以保留未碎裂的离子。
- 然后增加碰撞能量，对同一窗口内的离子进行碎裂，并采集产生的碎片离子的二级质谱信息。
是的，您对数据独立采集（Data Independent Acquisition, DIA）的基本原理理解得很准确。DIA通常通过以下步骤实现高低碰撞能量的交替采集：
1.全扫描一级质谱图：
首先进行一级质谱的全扫描，以获得样品中所有物质的m/z（质荷比）信息。这一步不涉及碎片化，而是用于记录样品中存在的所有离子的质荷比。
2.划分质量窗口：
然后将整个质量范围划分为若干个窗口（例如每个窗口覆盖一定的m/z范围）。这些窗口通常是连续的，并覆盖整个感兴趣的质量范围。
3.交替采集：
接下来，系统会循环地对每个质量窗口中的所有离子进行选择、碎裂（通过碰撞诱导解离，CID）和检测。
4.数据处理：
收集到的数据包括一级和二级质谱信息，这些信息可以用来鉴定和定量样品中的化合物。
DIA的优势在于它不依赖于特定离子的预先选择，因此可以同时采集大量化合物的信息，包括可能被忽略的或未知的化合物。这使得DIA非常适合复杂样品的全面分析。然而，这种方法也需要复杂的数据处理和分析策略，以从大量的数据中提取有用信息。
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