基于Label Free的定量蛋白组分析

    蛋白质非标记定量技术(Label Free)是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。

    基于SILACiTRAQ的定量蛋白组学研究技术都是首先标记蛋白然后利用质谱进行分析;尽管提供的蛋白定量信息量巨大,但是标记试剂比较昂贵,每一个样品的成本较大,因此比较适合在整个蛋白组水平上对蛋白的表达变化进行定量的分析;对于相对简单的蛋白混合物,比如说co-IP的样品来说,投入产出比比较低;对于某些翻译后修饰方式的蛋白组学研究来说,比如泛素化研究,本身泛素化就是发生在赖氨酸侧链上,对于泛素化肽段的富集是利用针对赖氨酸侧链上残留的两个甘氨酸(gly-gly)的抗体来实现的,但是iTRAQ试剂的标记会对此富集过程产生很大的影响,因此就不能使用iTRAQ标记技术对组织样品的泛素化修饰进行组学水平上的分析。Label Free定量分析技术就是基于此实验需求建立起来的定量蛋白组学技术。同一个肽段在质谱分析过程中离子化效率相同,质谱峰的面积就直接代表了该肽段量的多少,因此可以直接通过比较同一肽段质谱峰面积的方法直接得到该肽段所代表的蛋白的相对定量信息。

    百泰派克公司采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF质谱平台,Orbitrap Fusion质谱平台,Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC,推出基于Label Free的定量蛋白组分析服务技术包裹,您只需要将您的实验目的告诉我们并将您的细胞寄给我们,我们会负责项目后续所有事宜,包括细胞培养、细胞标记、蛋白提取、蛋白酶切、肽段分离、质谱分析、质谱原始数据分析、生物信息学分析。

    Label Free 定量蛋白组学分析流程

    Label Free定量蛋白组学服务流程

    Label Free定量蛋白组学服务流程


    关于样品

    1. 如果您提供的是co-IP样品,蛋白需求量在2-5ug左右,在寄送蛋白样品中不要包含去污剂(例如SDS)以及高的氧浓度;或者您可以直接将含有蛋白样品的beads寄给我们,由我们负责后续的实验。
    2. 如果您提供的是组织样品,请您干冰将组织样品寄给我们;动物样本大于200mg,血液样品至少1ml(血浆注意用EDTA防凝),血清0.2-0.5ml,尿液2ml,植物样品至少1g,细胞样品为1X10^7个细胞,酵母、微生物等干重200mg。
    3. 如果您提供的是蛋白样品,请您保证蛋白总量在50ug以上;蛋白提取时使用普通的组织、细胞裂解液即可。
    4. 样品运输:请使用足量的干冰运输,并且尽量选用较快的邮递方式,以降低运输过程中样品降解的可能性。

    中/英文项目报告

    在技术报告中,百泰派克会为您提供详细的中英文双语版技术报告,报告包括:

    1. 实验步骤(中英文)
    2. 相关的质谱参数(中英文)
    3. 质谱图片
    4. 原始数据
    5. 蛋白差异水平分析
    6. 生物信息学分析

    Label Free定量蛋白组学一站式服务

    您只需下单-寄送样品
    百泰派克一站式服务完成:样品处理-上机分析-数据分析-项目报告

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