代谢组学FAQ汇总
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代谢组学检测的主要方法是 NMR、LC-MS、GC-MS 和高效液相色谱及气相色谱。最近,高效液相色谱 (hplc) 是最流行的代谢组学检测技术。通过对一系列样品光谱的检测,结合化学模式识别方法,可以确定生物体的病理生理、基因功能、药物毒性和药效,且研究人员还可以识别相关的生物标志物。相关服
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• 用于GC-MS对细菌的无细胞上清液进行代谢组学分析需要对样品进行处理吗?如何处理?
这取决于很多因素以及具体的实验目的。引入GC-MS的任何样品都需要具有热稳定性并且还需要挥发,以便在GC柱上分离以进行有效质谱鉴定。如果实验目的是鉴定挥发物,则可能不需要对样品进行任何处理。如果是想寻找脂质、脂肪酸、酯类或类似的化合物,则可能需要某种预处理,例如衍生化技术酰化、烷基化和硅烷化
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理想的情况是冻干并浸渍组织样品,保持其完整性,这样样品预处理不会有问题,并且更容易运输。此外也可以使用液氮来冷冻组织并储存在-80℃,寄送时样品应与干冰一起运输。相关服务:代谢组学
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• 进行非靶向代谢组学研究哪种溶剂能为各种代谢物提供最佳的提取?
最好选用70%甲醇。相关服务:非靶向代谢组分析
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• 利用LC-MS进行非靶向代谢组学分析时发现质荷比和保留时间都非常接近的化合物,这种差异是如何造成的?
1、很可能是同位素;2、同一化合物的双峰(该化合物在特定颗粒中具有不同的形式,因此在色谱运行过程中分裂,产生两个紧密但不同的峰);3、感兴趣的化合物的异构体(相同的分子式,除了一个原子的位置外,结构非常相似);4、不相关的化合物(不太可能,但仍然可能)。相关服务:非靶向代谢组分析
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我们提供的三重四极杆(TSQ Access、Quattro LC)和离子阱(LCQ DECA XP)仪器可用于定量和定性。然而,离子阱仪器在全扫描模式下更加灵敏,并且具有执行提供额外结构信息的质谱实验的独特能力。因此,离子阱通常更适合定性分析。三重四极杆仪器可以在选择性离子监测 (SIM)
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代谢组学可以在靶向(您应该知道要量化哪些分子)和非靶向(尝试分析给定样品中的所有分子)分析中完成。相关服务:代谢组学
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分析必须使用高分辨率仪器(QTOF、Orbi-traps)和定量仪器(Triple Quad 或 Qtrap)。相关服务:代谢组学
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在分析中,你尝试使用高分辨率仪器分析给定样品中所有可能的分子,而在量化时,你只对某些化合物感兴趣。相关服务:代谢组学
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通常这涉及使用稳定同位素标记的内标,该内标以已知浓度加到样品中。然后将通过 LC-MRM-MS 获得的分析物和标记化合物之间的响应比插值到标准曲线上,以计算未知样品中分析物的绝对含量。
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