代谢组学FAQ汇总
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• 利用LC-MS进行非靶向代谢组学分析时发现质荷比和保留时间都非常接近的化合物,这种差异是如何造成的?
1、很可能是同位素;2、同一化合物的双峰(该化合物在特定颗粒中具有不同的形式,因此在色谱运行过程中分裂,产生两个紧密但不同的峰);3、感兴趣的化合物的异构体(相同的分子式,除了一个原子的位置外,结构非常相似);4、不相关的化合物(不太可能,但仍然可能)。相关服务:非靶向代谢组分析
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我们提供的三重四极杆(TSQ Access、Quattro LC)和离子阱(LCQ DECA XP)仪器可用于定量和定性。然而,离子阱仪器在全扫描模式下更加灵敏,并且具有执行提供额外结构信息的质谱实验的独特能力。因此,离子阱通常更适合定性分析。三重四极杆仪器可以在选择性离子监测 (SIM)
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代谢组学可以在靶向(您应该知道要量化哪些分子)和非靶向(尝试分析给定样品中的所有分子)分析中完成。相关服务:代谢组学
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分析必须使用高分辨率仪器(QTOF、Orbi-traps)和定量仪器(Triple Quad 或 Qtrap)。相关服务:代谢组学
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在分析中,你尝试使用高分辨率仪器分析给定样品中所有可能的分子,而在量化时,你只对某些化合物感兴趣。相关服务:代谢组学
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通常这涉及使用稳定同位素标记的内标,该内标以已知浓度加到样品中。然后将通过 LC-MRM-MS 获得的分析物和标记化合物之间的响应比插值到标准曲线上,以计算未知样品中分析物的绝对含量。
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在先进的 LC-MS 系统的帮助下,通过使用特定的内标 (ISTDs) 尝试量化目标分子。相关服务:代谢组学
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任何种类的生物样品(血清、血浆、唾液、组织、尿液、植物提取物和细胞提取物)。如果您有既定的提取代谢物的流程,您可以对其进行处理并将干燥产物提供给我们。相关服务:代谢组学
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核磁共振:核磁共振具有检测不损样品、无需复杂的样品前处理,使样品尽可能接近其生理状态等优点。但是,它的灵敏度较低,尤其是对低丰度的代谢物。 LC-MS:液相色谱和质谱相结合的技术,具有较高的分辨率、较高的灵敏度,可以检测多种代谢物。通常用于检测小于 1000 Da 的非挥发性极性化合物。 G
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差异代谢物筛选标准:选择倍数变化≥2和倍数变化≤0.5的代谢物。如果对照组和实验组之间代谢物的差异大于2倍或小于0.5,则认为差异显著。如果样本分组中存在生物学重复,在上述基础上,选择VIP≥1的代谢物。VIP 值代表了模型中各组样本中对应代谢物的差异对分类和判别的影响。一般认为VIP≥1的
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