代谢组学FAQ汇总
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代谢组学是对来自任何生物样品的小生物分子的大规模分析。该术语适用于非靶向代谢组学,我们不是测量一组已知化合物,而是更全面地分析每一种可能的化合物,看看哪些是相关的和有趣的。典型的代谢组学是用现代分析仪器进行的,包括质谱和核磁共振。相关服务:代谢组学
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只要生物样品至少有两组,并至少有三个重复(例如,对照和处理),我们就可以分析代谢物并进行组间比较。也可以对单个样品进行完全的探索性分析而不进行比较(即在某个样品中可以找到哪些种类的代谢物)。我们的方法适用于所有生物流体、组织、植物、食物、整个昆虫、细胞培养物、肠道内容物等。相关服务:代谢组学
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每次分析中代谢物的组成取决于各种因素,包括样品类型、采样方案、提取程序和化合物的电离效率。在我们的分析中经常检测到各种化合物类型,例如氨基酸、酰基肉碱、各种脂质类型、胆汁酸、植物化学物质和微生物群产生的化合物。然而,我们并不将分析仅限于我们之前检测到的化合物,因此非靶向代谢物分析允许在代谢物
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由于分析的大范围性质,单一化合物将以相对水平而不是浓度(例如 mg/L)来测量,仍然允许在样品间进行全面比较。1500 Da 以上的肽、蛋白质、DNA 和复合碳水化合物等大分子将在样品制备过程中被淘汰,不在代谢组学分析范围内。相关服务:代谢组学
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您可能听说过代谢分析的最大障碍之一就是大多数检测到的化合物是无法鉴定的。这在某种程度上是正确的。质谱领域的技术进步比鉴定数据库快得多。这主要是因为当前的技术可以通过一次分析运行检测大量不同的代谢物。我们的团队在探索代谢组学分析中出现的新化合物方面拥有长期经验,并且由于我们喜欢探索化合物光谱,
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是的。非靶向代谢物分析方法是一种半定量测量,测量中在样品或不同研究组之间比较代谢物信号,并详细识别在统计和化学计量分析中显示出显著差异的信号。在非靶向代谢物分析实验中,对照样品来自相同/相似的样品基质、来自尽可能相似的条件、并采用相同的取样程序收集是重要的。在计划实验时就应考虑这些问题,我们
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我们通常使用 100 μL 的生物流体(血浆、血清、尿液、唾液),但在样品可用性有限的情况下(例如小鼠血浆),可以使用更少的量(50 μL)。组织样本的量应至少为 50 mg,细胞培养试验中的细胞数量应在一百万左右。相关服务:代谢组学
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关键区别在于灵敏度。质谱 (MS) 比核磁共振 (NMR) 灵敏几个数量级。在基于 NMR 的代谢组学分析中,例如人血浆,测量通常涵盖样品中高浓度存在的 200-300 种预定义化合物。在基于 MS 的代谢谱分析中,样品中存在的数千种化合物产生的所有化学信号都在分析中被考虑在内。使用 MS
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代谢物代表了极其多样化的分子,包括氨基酸、脂质、激素、碳水化合物等。一个生物系统内的内源性代谢物的合辑被统称为“代谢组”。相关服务:代谢组学
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• PCA主成分分析的loading图中,P=COSα中P代表什么意思?
P值代表PCA维度中X变量的重要性。相关服务:主成分分析( PCA)
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