单细胞分析FAQ汇总

• • 单细胞RNA测序样品处理流程是什么？

  首先对样品进行活细胞计数以及存活率测量，为了确保最高质量的数据，必须尽快在10x Genomics Chromium系统上处理细胞。相关服务:单细胞测序

• • 死细胞会影响单细胞RNA测序数据质量吗？

  当然会，细胞存活率低通常会导致测序目标丢失和结果不理想。此外，死亡或凋亡细胞释放的RNA会增加背景噪音，影响数据质量。为了使单细胞测序中有用的数据量最大化，必须将死亡细胞的比例降到最低。建议细胞存活率超过90%，最低为70%。存活率低于70%的样品可进行死细胞去除。相关服务:单细胞测序

• • 如何去除单细胞样本中的死细胞？

  使用与膜联蛋白V抗体结合的磁珠清除死细胞。珠子可以捕捉死细胞从而丰富活细胞样本。相关服务:单细胞测序

• • 10X Chromium系统每个样本可以测序多少个细胞？

  要揭示一个组织或细胞群体中基因表达的完全多样性，通常需要对成百上千的活细胞进行分析。研究人员可以灵活地指定要测序的细胞数量，从每个样本500个细胞到10000个细胞。通常建议在大多数实验中，每个样本针对3000个细胞比较合适。相关服务:单细胞测序

• • 单细胞转录组测序需要多少次读数？

  所需的读取次数取决于基因组大小、已知基因的数量、细胞类型和转录本。通常，我们建议每个细胞读取 100，000 次，以最大限度地识别转录本。相关服务:单细胞测序

• • 单细胞转录组测序可以使用哪些类型的数据分析？

  数据使用10x Genomics 的Cell Ranger软件进行分析，包括读取对齐、特征条码矩阵、数字基因表达矩阵、聚类、基因表达分析以及t-SNE预测。相关服务:单细胞测序

• • 10x Genomics单细胞方法可以进行哪些类型的细胞分析？

  单个细胞的转录组通常是细胞特性和功能的关键，10X Genomics单细胞基因表达分析可以检测样本中每个细胞的RNA含量。Chromium 单细胞ATAC可以识别单个细胞内基因组中的开放染色质区域。通过单细胞多组学对不同组群的数据集进行分析和整合，可以测量同一来源的多个细胞特征以及整个转录组

• • 单细胞测序的作用有些什么？

  单细胞测序（Single-cell sequencing）是一种强大的技术，它能够在单个细胞级别解析基因表达和功能，这对于理解细胞间的差异性、生物过程以及疾病发生的机制都非常有用。其主要应用体现在以下方面： 1.理解细胞异质性：一个组织或者样本中的细胞并非全都相同，它们

• • 单细胞测序包含哪几个步骤？

  单细胞测序（Single-cell sequencing）是一种研究单个细胞中的基因表达和功能的技术。它在发育生物学、肿瘤生物学、神经科学等领域具有广泛的应用。单细胞测序通常包含以下几个主要步骤： 1.单细胞分离：首先需要从组织或细胞群体中分离单个细胞。这可以通过机械分

• • 如何确定单细胞测序发现的新细胞群的功能？

  确定单细胞测序发现的新细胞群功能的方法有很多，比如：1. 转录组分析：首先，对新发现的细胞群进行基因表达谱分析。查找这些细胞所特异性表达的基因，并与已知细胞类型的基因表达进行比较。这有助于揭示新细胞群可能的功能特性。