单细胞分析FAQ汇总
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同一个细胞不同同时做两种测序，可以将一份样品分为两份，一部分进行10X scRNA，另一部分抽核后进行10X scATAC相关服务:单细胞测序
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人和鼠的TCR或者BCR。相关服务:单细胞测序
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细胞捕获数与样本活性与细胞浓度密切相关，一般可捕获5000细胞；基因检出数与样本状态有关，不同的类型样本，基因检出数也可存在数倍的差异。相关服务:单细胞测序
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10x Genomics只是单细胞分析的众多不同方法之一，还有基于平板和微孔的方法。与基于微流体的10x Genomics提供的通量相比，这些方法的通量通常较低，相关服务:单细胞测序
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早期规划阶段有许多注意事项，样品制备无疑是一个重要的起点。要考虑的一件事是使用的样品类型是组织、细胞悬浮液还是全血？它是否需要解离、富集或纯化？此外，还应考虑每个实验条件所需的样品数量以及是否需要技术重复。缩小到单个样品的范围应该考虑每个样品需要多少个细胞才能获得所需的结果。相关服务:单细胞
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考虑开始使用的细胞数量非常重要，特别是在考虑样品制备的清理方法时。一些净化方法，如密度离心或死细胞去除，需要更高的起始细胞数，并导致大量样品损失。如果使用的是有限的样本，最好进行几次清洗和旋转，而不是花时间进行可能会导致样本丢失的更复杂的清理。也可以进行荧光激活细胞分选（FACS）以保留更多
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• 如果两个单细胞测序样本是并行处理的，那么在集成数据集时是否仍应使用批处理效果校正？
当我们谈论批次效应时，通常指的是在不同技术或不同平台上处理样品时产生的样品之间的技术差异。如果实验设计很好，这也是可以预防的。例如，组合两个样本并并行处理它们，这实际上是防止批次效应的好方法。在集成两个数据集时，如果两个样本之间的排序深度存在差异，则可能需要规范化它们。这种规范化是在Cell
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批量RNA测序和单细胞RNA测序之间的主要区别在于，每个测序文库代表单个细胞，而不是细胞群体。因此，没有办法在单细胞水平上进行“生物复制”：每个细胞都是独一无二的，不可能复制。相关服务:单细胞测序
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单细胞测序技术可以将细胞一一分开，观察细胞与细胞之间的异质性和相似点，在细胞层面和细胞类群层面进行多维度的解析。相关服务:单细胞测序
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不同物种、组织由于研究的目的不同对细胞类别的需求也是不同的，一般制备好的单细胞悬液或血液、组织均可，细胞活性不低于80%，细胞浓度介于5*10^5-1.2*10^6/ml之间最好，细胞总数最好大于10^5个。另外，细胞培养基及缓冲液中不能含金属钙离子和镁离子。相关服务:单细胞测序
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