单细胞分析FAQ汇总
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有影响，这种影响也是不可避免的，目前常用的方法中都多多少少对细胞有些影响。酶消化会使细胞产生应激反应，机械操作则容易损伤细胞，进而影响细胞活性。相关服务:单细胞测序
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可以从以下几个方面进行判断：1、捕获到的细胞数量：捕获到的细胞数量越多，证据越充分；2、细胞中的平均reads数：一般大于3万是比较好的数据；3、细胞中的中位基因值：该值的大小与不同的组织样本有关，如癌细胞中可能数值较高；4、测序的饱和度：一般大于50%即可；5、测序得到的reads比对到高
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细胞类型的判断可以参考同类物种或样本的已发表文章，或者根据数据库如CellMarker、panglao等去确定Marker基因。相关服务:单细胞测序
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单细胞测序研究最热的是对转录组进行测序研究。当然，还可实现的检测有染色质可接近性检测（ATAC-seq）、CNV检测、免疫组库测序和表面蛋白检测等。相关服务:单细胞测序
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1、活细胞率越高越好，至少达到90%；2、保证细胞数量在10^5左右；3、细胞直径在几十微米以内，最好40um以下；4、植物细胞需要去除细胞壁，制备原生质体。相关服务:单细胞测序
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可以的，因为由于实验样本的特殊性，并不是所有的细胞都能满足现有测序要求，比如神经细胞等。不满足测序条件的单细胞可以通过细胞核提取，进行核转录组检测。相关服务:单细胞测序
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将根据单细胞测序数据分类得到的markers与已知类群marker基因进行匹配。如果匹配到某个类群里有已知的marker，就能对这些类群进行已知类型标记。相关服务:单细胞测序
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单细胞转录组测序最主要的目的是可以进行细胞定义，此外，还可以利用该数据进行转录因子预测、拟时序分析、细胞互作预测和功能富集等分析。相关服务:单细胞测序
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单细胞RNA-Seq提供数千个单个细胞的转录分析。这种通量分析水平使研究人员能够在单细胞水平上了解异质样品中数千个细胞表达的基因，表达量以及它们之间的差异相关服务:单细胞测序
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• 单细胞RNA测序与传统和超低输入的RNA测序有什么区别？
标准RNA测序可以检测所有细胞平均转录状态，传统RNA测序的不足是单个细胞和细胞亚群的分辨率丢失。单细胞RNA测序使研究人员不仅能够识别细胞亚群，而且能够在异质样本中的单细胞水平上对其进行全面分析。与标准RNA测序类似，超低输入RNA测序提供整个细胞群体的批量表达分析；但是其通量非常有限，低
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