如何判定单细胞测序的数据质量?
可以从以下几个方面进行判断:1、捕获到的细胞数量:捕获到的细胞数量越多,证据越充分;2、细胞中的平均reads数:一般大于3万是比较好的数据;3、细胞中的中位基因值:该值的大小与不同的组织样本有关,如癌细胞中可能数值较高;4、测序的饱和度:一般大于50%即可;5、测序得到的reads比对到高质量细胞的占比:如果细胞活性偏低,这个数值会偏低。
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