一个蛋白一个化学药物小分子可以采用GST PULL down吗?
GST Pull-Down 实验主要用来鉴定蛋白-蛋白间的相互作用。这种方法的原理是通过转基因方式将目标蛋白质与谷胱甘肽 S-转移酶(Glutathione S-transferase, GST)基因融合,利用GST蛋白与谷胱甘肽(Glutathione)的高亲和性,将GST融合蛋白与小鼠抗-GST抗体偶联的免疫磁珠结合,然后通过洗涤步骤去除非特异性结合的蛋白,最后用SDS-PAGE或免疫印迹方法检测与GST融合蛋白特异性结合的蛋白。
因此,GST Pull-Down可能不是研究一个蛋白和一个化学药物小分子的相互作用的最佳选择。因为相比于蛋白质-蛋白质之间的相互作用,小分子-蛋白质的相互作用往往更难通过这种方法在生理条件下稳定地检测出来。小分子化合物通常没有足够的结构复杂性或尺寸来形成稳定的、可以被拉下的复合物。其次,小分子很难被直接固定到磁珠上而不改变其活性或与蛋白质的相互作用。此外,GST Pull-Down技术需要使用特殊的缓冲液和洗涤步骤,这些条件可能会影响小分子与蛋白质之间的相互作用。而且,这种方法通常需要较大量的样本,并且结果可能受到融合标签的影响。
相对而言,研究蛋白质和小分子化学药物之间的相互作用,更常用的方法有表面等离子共振(SPR)、同位素稀释质谱法(ID-MS)以及荧光共振能量转移(FRET)等,这些方法能直接测量小分子与蛋白质的结合,且可在生理条件下进行。当然,哪种方法最适合会根据具体的实验目标和条件来确定。
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