请问体内交联方法是怎样的?
下面是一个体内交联实验通用的方法步骤可供您参考:
一、交联剂的选择
选择合适的交联剂是体内交联成功的关键,不同的交联剂有不同的作用距离(即可连接分子的最大距离)和化学性质,适合不同类型的分子相互作用。常用的交联剂有以下几种:
1、甲醛:适用于捕捉短暂的蛋白质-蛋白质和蛋白质-核酸相互作用,渗透性好,且易逆转,常用浓度为0.5%-1%。
2、戊二醛:具有较强的交联能力,适合固定更稳定的蛋白质复合物,但其渗透性较差,且通常不易逆转。
3、其他交联剂(如二硫化物交联剂、二异氰酸酯类交联剂等):适用于特定反应条件和分子结构的研究。
二、交联反应的实施
将交联剂加入细胞或组织中,控制浓度和反应时间(如甲醛0.5%-1%,10-30分钟)以避免非特异性交联。
三、终止交联反应
用甘氨酸(通常为0.1 M)终止反应,并用PBS或其他缓冲液洗涤样品去除剩余交联剂,减少对后续实验的干扰。
四、样品裂解
通过缓冲液和机械方法裂解细胞,释放交联的蛋白复合物
五、复合物的富集与检测
使用免疫共沉淀富集目标蛋白复合物,并用SDS-PAGE或质谱等方法进行检测。
六、数据分析
体内交联后获得的复合物通过质谱或免疫检测确认后,可进一步分析相互作用网络。
七、注意事项
1、交联剂浓度和时间优化:交联浓度过高或时间过长可能导致非特异性相互作用,需要在预实验中优化这些条件。
2、样品保存:交联后的样品通常可短期保存于4°C,但长期保存建议在-80°C。
3、实验重复性:由于体内交联涉及动态的蛋白质复合物,建议进行多次重复实验以验证结果的可靠性。
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