蛋白分析FAQ汇总

• • 请问做人血浆蛋白质组学什么情况需要去除高丰度蛋白呢?

  在做人血浆蛋白质组学时，需要去除高丰度蛋白的情况包括：提高低丰度蛋白的检测灵敏度，研究特定生物标志物，提高数据的重现性和准确性，优化样品分离和分析方法。

• • 为什么多聚谷氨酸PH小于等于4时R基团不带电呢？

  多聚谷氨酸的R基团是侧链羧酸基（-COOH），当pH小于或等于4时，环境中氢离子浓度较高，羧酸基会质子化，从而变为不带电的形式（-COOH）。此时，羧酸的离解常数（pKa）未达到，使得R基团中的负电荷被质子中和。因此，在这种酸性环境下，R基团表现为中性，不带电。

• • 请问怎么看一个蛋白的糖基化位点多不多？

  查看一个蛋白的糖基化位点多不多，常用的途径有数据库查询、通过生物信息学预测和实验检测等多种方式。

• • 请问预测N-糖基化位点可以用什么软件来测试呢？

  在生物研究领域，对于N-糖基化位点的预测，研究者们常用到一些生物信息学的软件和平台，如NetNGlyc、GlycoEP、GPP Prediction Server等。这些软件都有各自的特性和优势，一般会根据实际研究需求来选取。

• • 请问有没有泛sumo的抗体推荐？

  在选择泛SUMO抗体时，可以使用的泛SUMO抗体包括CST的#4940和#4971，Santa Cruz的sc-5308和sc-32874，以及Abcam的ab133352和ab3742。选择时应考虑特异性、灵敏度和实验适用性，并查阅技术资料和用户评价。

• • 请问有什么荧光探针可以用来检测二硫键吗？

  二硫键对蛋白质的结构和功能至关重要，检测其存在的荧光探针具有重要应用价值。Cyanine5-maleimide通过与硫醇基团反应形成稳定的硫醚键，发出近红外光，适合深层组织成像。而ThiolTracker™ Violet则专门用于细胞内二硫键的检测，具有高选择性和敏感性，发出紫外光信号，且可

• • 如果直接用sumo化抗体检测该细胞sumo水平是不是应该泛sumo和sumo1和sumo2/3都得测?

  在使用SUMO化抗体检测细胞中的SUMO水平时，最好同时测量泛SUMO、SUMO1和SUMO2/3。泛SUMO抗体提供总体修饰水平的概览，而SUMO1和SUMO2/3抗体则能定量特定亚型的修饰情况，以便深入了解它们在细胞功能中的作用。尽管在某些情况下，如只关注SUMO1时，可以选择不测量其他

• • 请问蛋白质表面连接一个肽类能否用质谱检测？

  质谱可用于研究蛋白质和肽的结构以及它们之间的相互作用。如果一个蛋白质表面连接一个肽，质谱可以用来鉴定和定量这种连接，以及了解其在生物学过程中的作用。质谱可以推导出肽的氨基酸序列和蛋白质的结构信息，包括连结点，鉴定蛋白质的化学修饰，以及测量蛋白质及其复合物的分子质量。

• • 诱导和未诱导的蛋白条带没有差别，这是什么问题？

  诱导和未诱导条件下蛋白条带没有差别可能是由于诱导剂条件不充分、蛋白质本身高表达、蛋白质降解、表达系统问题或SDS-PAGE电泳与染色问题等因素所导致，这些问题会影响诱导效果或条带的可见性，需要针对性优化实验条件和检测步骤。

• • 请问直接用sumo化抗体就可以检测该细胞sumo水平是否有变化吗？

  直接用SUMO化抗体可以检测细胞中整体的SUMO化水平是否发生变化，但如果需要研究特定蛋白的SUMO化情况，或者想要区分不同类型的SUMO修饰，可能还需要进一步的实验步骤。