蛋白分析FAQ汇总

• • 请问waters-TQS的mrm模式操作步骤是怎样的？

  Waters Xevo TQS (Triple Quadrupole Mass Spectrometer) 在 MRM (Multiple Reaction Monitoring) 模式下的操作步骤如下：

• • 请问蛋白质组学测序同一样品需要设置多个重复吗？

  在蛋白质组学测序中，即使对同一样品进行分析，设置多个重复（包括技术重复和生物重复）是必要的。在蛋白质组学实验中通常会采用生物学重复和技术重复两种方式。

• • 请问western电泳液可以重复用吗？和新的电泳液比有什么区别？

  Western电泳中的电泳液（通常指的是分离胶和浓缩胶的电泳缓冲液）不推荐重复使用，但是否能重复使用以及重复使用后的效果如何取决于多个因素。

• • 请问转录本序列可以直接设计引物吗？

  转录本序列（mRNA序列）是通过基因的转录生成的，可以作为引物设计的基础，但设计引物时需要考虑一些重要因素。

• • 请问有没有预测蛋白甲基化位点的网站？

  在蛋白质甲基化位点预测方面，以下工具和数据库较为常用，适用于不同研究需求：

• • 请问DeNovo only peptides和DB peptides两个表有什么区别啊？

  在蛋白质组学的质谱数据分析中，DeNovo only peptides和DB peptides是两类不同的肽段鉴定结果，核心区别体现在以下三点：

• • 一个蛋白怎么查结构域，怎么截断结构域形成新的突变体，构成新的质粒？

  查找蛋白质的结构域、截断结构域形成突变体以及构建新的质粒是生物学和分子生物学研究中常见的实验步骤，以下是每个步骤的过程。

• • 请问sumo预测的位点突变后导致泛素化减少是有什么原因呢？

  SUMO预测位点突变导致泛素化减少的可能机制如下：竞争性修饰干扰，协同信号通路依赖，复合体稳定性受破坏，去泛素化酶（DUB）调控失衡。

• • 我提取细胞蛋白还没有归一化(没加lodingbuffer和pbs)，放在-20°C之后能保存多久呀？

  未进行归一化（未添加loading buffer或PBS）的细胞蛋白样本在-20°C保存的稳定性受以下关键因素影响：蛋白水解风险，pH稳定性。

• • 蛋白没有加Buffer，也没有煮沸，在-20°C冰箱里能放多久呀？

  未添加任何缓冲液（Buffer）且未经煮沸的蛋白质样本在-20°C冰箱中的保存时间受多种因素影响，具体分析如下：