蛋白的磷酸化和糖基化位点预测

    蛋白质磷酸化和糖基化是常见的蛋白质翻译后修饰,能在一定程度上影响蛋白质的结构和生物学功能,使被修饰的蛋白质发挥特殊的调控功能。

    蛋白磷酸化是在特异性蛋白激酶催化作用下,蛋白氨基酸残基共价结合三磷酸腺苷(ATP)或三磷酸鸟苷(GTP)的过程。该修饰是可逆的,在蛋白磷酸酶的作用下,蛋白质可以发生去磷酸化。

    蛋白磷酸化位点分析即鉴定蛋白质磷酸化发生在肽链的几号位氨基酸上以及发生在何种氨基酸上。可通过磷酸酶法、串联质谱测序法等方法进行检测,其思路大致为将样品蛋白进行酶解,得到肽段混合物,然后特异性识别并富集发生磷酸化的肽段,再对该肽段的氨基酸序列进行分析,找出发生磷酸化的位点。

    蛋白糖基化修饰在真核生物中非常普遍,几乎有一半以上的蛋白质发生了这种修饰。蛋白糖基化一般发生在特定位点的氨基酸残基上,根据发生糖基化修饰的氨基酸位点以及结合的糖链类型,可以将糖基化修饰分为N-糖修饰、O-糖修饰以及糖基磷脂酰肌醇锚三类。

    蛋白糖基化位点分析主要研究蛋白质在哪个氨基酸位点发生何种糖基化。其大致的分析策略是先检测或确定糖蛋白的存在并对其进行富集分离;然后利用生物质谱结合蛋白酶或专一性糖苷内切酶的作用对收集的糖蛋白进行糖基化氨基酸位点鉴定,再将糖基化位点进行特异的质量标记使之与未发生糖基化的蛋白质之间存在一定的质量差异,通过质谱分析检测这些差异,进而通过串联质谱鉴定该糖基化修饰发生的氨基酸位点;最后进行糖链结构鉴定以确定发生的糖基化类型,这是整个鉴定工作中最难最复杂的一步,目前主要采用基质辅助激光解吸电离质谱(MALDI-TOF-MS)和核磁共振(NMR)技术进行研究。

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    相关服务:
    磷酸化蛋白质组学
    翻译后修饰蛋白组分析
    泛素化定量蛋白组学研究
    组蛋白翻译后修饰分析
    糖基化定量蛋白组学研究
    糖蛋白分析
    糖型分析
    糖基化位点分析
    糖基化位点及该位点糖型分析

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