dDIA(directDIA)与使用计算机内库(in-silico library)相比如何?

    directDIA和in-silico library工作流程都试图解决在没有库的情况下分析DIA运行的问题,但它们的实现方式截然不同。 计算机库基于对整个消化蛋白质数据库的光谱和保留时间的预测,从而产生大型但不是特定于样品的库。 相比之下,directDIA工作流程首先直接在您的DIA运行中执行经典数据库搜索以创建库,然后使用该库对相同的DIA运行进行有针对性的分析。directDIA 中的这两个步骤都受到假阳性率(FDR)的严格控制,分析质量与使用特定样本库时相似。 这也意味着directDIA本身支持翻译后修饰和非胰蛋白酶搜索空间,这两者都很难用计算机内库覆盖。


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