dDIA(directDIA)与使用计算机内库（in-silico library）相比如何？

directDIA和in-silico library工作流程都试图解决在没有库的情况下分析DIA运行的问题，但它们的实现方式截然不同。计算机库基于对整个消化蛋白质数据库的光谱和保留时间的预测，从而产生大型但不是特定于样品的库。相比之下，directDIA工作流程首先直接在您的DIA运行中执行经典数据库搜索以创建库，然后使用该库对相同的DIA运行进行有针对性的分析。directDIA 中的这两个步骤都受到假阳性率(FDR)的严格控制，分析质量与使用特定样本库时相似。这也意味着directDIA本身支持翻译后修饰和非胰蛋白酶搜索空间，这两者都很难用计算机内库覆盖。

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