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• • 体外结合实验与免疫沉淀的区别

  -蛋白质体外结合实验（即Pull-down实验）和免疫沉淀（Immunoprecipitation，IP）是研究蛋白质相互作用的两种方法，两者存在一定区别又可互为验证试验。

• • CO-IP后做质谱实验分组的设计

  -免疫沉淀（Immunoprecipitation，IP）是利用固定在磁珠或琼脂糖树脂等基质上的特异性抗体对抗原进行小型亲和纯化的一种方法。免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation，Co-IP）是一种常用的鉴定蛋白-蛋白相互作用的方法，通过使用诱饵蛋白（IP中的抗原，bait

• • SILAC-MS-IP

  -免疫共沉淀（Co-IP）是以抗体和抗原之间的专一性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的经典方法，用于确定两种蛋白质在完整细胞内生理性相互作用。其原理是：当细胞在非变性条件下被裂解时，完整细胞内存在的许多蛋白质-蛋白质间的相互作用被保留了下来。这种方法常用于测定两种目标蛋白质是否在体内结合，

• • SILAC-IP

  -SILAC（Stable Isotope Labeling with Amino acids in Cell culture）技术即细胞培养条件下稳定同位素标记技术，采用含有轻、重同位素型必需氨基酸（主要是Lys和Arg）的培养基进行细胞培养，细胞传代若干代后（一般培养5-6代），细胞内蛋

• • IP样品考染

  -IP样品考染即将免疫沉淀（Immunoprecipitation，IP）拉下的蛋白样品电泳后进行考马斯亮蓝染色。在获得IP样品之后，质谱检测之前，一般需要将IP样品进行电泳预实验以评估其质量。通过十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE）及考马斯亮蓝染色（简称考染）预实验可评估

• • IP后跑胶

  -在获得免疫沉淀（IP）样品之后，由于质谱检测的成本相对较高，需要在IP样品进行质谱检测之前进行IP后跑胶预实验。通过十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE）分别进行蛋白质印迹（Western blot，WB）及银染或考染预实验,评估该IP样品是否适用于质谱检测。通过SDS-P

• • IP质谱结果分析

  -免疫沉淀（IP）是研究蛋白质相互作用的一种经典技术，而免疫沉淀串联质谱分析（IP-MS）是目前应用最广泛的蛋白相互作用研究方法之一。在对IP样品进行质谱检测之后，需要进行IP质谱结果分析才能得出最终的结论。在目前的IP-MS处理中，常以蛋白的非标记定量信号强度（LFQ intensity）

• • 通过IP所得样本进行蛋白质谱分析

  -一般的质谱技术是不能直接研究蛋白互相作用的，需要和其他技术联用，如通过免疫沉淀（IP）所得样本进行蛋白质谱分析，然后再用质谱法鉴定IP所得样品中的蛋白质。甚至于可以比较不同样本中，这些蛋白的相对丰度并寻找差异蛋白。质谱技术不仅能够验证已知蛋白相互作用，还可以鉴定与目标蛋白发生相互作用的未知

• • IP-MS打质谱非特异互作的蛋白一般有哪些

  -免疫沉淀（IP）是研究蛋白质相互作用的一种经典技术，而免疫沉淀串联质谱分析（IP-MS）是目前应用最广泛的蛋白相互作用研究方法之一。IP-MS的主要原理是基于特异性抗体或其他亲和试剂与靶标蛋白的亲和作用，通过免疫共沉淀（Co-IP）将靶标蛋白与靶标蛋白相互作用的蛋白从复杂的样本中提取出来，

• • 磷酸化质谱图怎么看

  -质谱除了被用来确定单一蛋白质的磷酸化修饰状态，还被用来确定带有磷酸化修饰的所有蛋白质的广泛数据集，那么磷酸化质谱图怎么看？在磷酸化蛋白质谱（如MS/MS，LC-MS/MS）分析中，先使试样中各组分电离生成不同荷质比的离子，然后经加速电场的作用生成离子束。在质量分析器的磁场作用下，质荷比相同