通过IP所得样本进行蛋白质谱分析
一般的质谱技术是不能直接研究蛋白互相作用的,需要和其他技术联用,如通过免疫沉淀(IP)所得样本进行蛋白质谱分析,然后再用质谱法鉴定IP所得样品中的蛋白质。甚至于可以比较不同样本中,这些蛋白的相对丰度并寻找差异蛋白。质谱技术不仅能够验证已知蛋白相互作用,还可以鉴定与目标蛋白发生相互作用的未知蛋白。
IP即免疫沉淀,它是用靶蛋白的特异性抗体捕获细胞内的靶蛋白复合物。基于“靶蛋白抗体-靶蛋白-互作蛋白”这一特殊结构,我们可以用靶蛋白抗体将未知的互作蛋白从细胞中“揪出来”。拿到互作蛋白我们需要知道蛋白的“身份”,质谱就是一种对IP所得样本中蛋白进行定性的好方法,其基本流程是将样本进行酶解并利用质谱进行分析,然后用收集到的肽段信号,比对数据库,从而达到定性蛋白质分子的目的。
质谱的检测方式有很多,比如液质联用(LC-MS)技术和串联质谱(MS-MS)技术。针对IP后的样本,一般我们会选用液相色谱串联质谱(LC-MS-MS)的方式检测。先通过液相进行有效分离,将各蛋白质组分分开,再通过二级质谱进行片段化检测定性,真正的将蛋白定性做到速度快且数据精准。
百泰派克生物科技结合MALDI-TOF质谱系统与LC-MS/MS质谱系统,提供专业准确的蛋白胶点、胶条以及IP样品,CO-IP样品蛋白鉴定服务。可鉴定的样品包括但不限于:1D-SDS PAGE分离的蛋白胶条,2DE PAGE中的蛋白胶点,蛋白表达产物,免疫共沉淀(Co-IP)样品。只需要将您的实验目的告诉我们并寄送样品,百泰派克生物科技将会负责完成样品处理、上机分析、数据分析、项目报告等项目后续服务。
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