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细胞在面对外界环境刺激(如氧化应激、热休克、DNA损伤、营养剥夺等)时,会迅速启动一系列信号通路和转录翻译调控机制,以维持内稳态或诱导凋亡。这一过程被统称为细胞应激反应(cellular stress response),在疾病发生、药物响应和衰老等领域具有重要研究价值。 然而,应激反应
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肿瘤发生发展是一个复杂的多阶段过程,涉及基因表达重编程、信号通路失衡、微环境重塑等多重机制。蛋白质组学技术为揭示这些过程提供了系统化工具,但如何实现不同状态下的蛋白定量比较,依然是当前研究的核心难题之一。在这一背景下,多重SILAC标记(Multi-plexed SILAC)技术应运而生。作
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一、蛋白质乳酸化的发现 长期以来,乳酸(Lactate)被视为细胞代谢中的“废弃物”。在经典代谢路径中,细胞在缺氧或高强度代谢状态下会启动糖酵解,快速将葡萄糖转化为丙酮酸。由于缺乏氧气,丙酮酸无法进入线粒体的三羧酸循环,而是被还原为乳酸,以再生NAD⁺供糖酵解持续进行。这一过程虽然维持了能量
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定量蛋白质组学的核心是利用质谱(MS)在不同实验条件下准确测量蛋白质的丰度。质谱的高分辨率和高灵敏度可以精确量化蛋白质的表达水平,结合一些定量方法还可以同时分析多个样本。最常用的策略包括非标记定量和标记定量。一、非标记定量蛋白质组学 非标记定量是指不依赖任何化学或同位素标记的定量方法。蛋白质
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蛋白质通过构建互作网络来执行几乎所有的生物学功能,包括信号转导、代谢调控、转录调控和细胞结构维护等。蛋白互作研究因此成为揭示细胞功能机制和疾病发生基础的重要方向。共免疫沉淀(Co-immunoprecipitation, Co-IP)作为经典的互作检测手段,具有特异性强、操作简便的优势,但其
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Stable Isotope Labeling by Amino acids in Cell culture(SILAC,稳定同位素标记的细胞培养)广泛应用于定量蛋白质组学的代谢标记。相比于iTRAQ、TMT等化学标记方法,SILAC因其在细胞水平完成同位素标记,天然避免了样本处理过程中引入
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在蛋白质组学和靶向代谢组学等生命科学研究中,精确定量低丰度分子至关重要。质谱(Mass Spectrometry, MS)技术中,SRM(Selected Reaction Monitoring)和PRM(Parallel Reaction Monitoring)是两种主流的靶向定量策略,广
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糖基化是一类高度复杂且具有生物学功能的重要翻译后修饰,广泛参与细胞识别、信号传递、免疫应答等生命过程。定量糖蛋白质组学通过高通量质谱技术,解析糖蛋白的表达水平及其糖基化修饰位点,为疾病机制研究和临床标志物发现提供数据支撑。为了获得准确、可重复的分析结果,科学规范的实验流程与高质量的样本准备至
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在蛋白质组学研究中,如何实现对特定蛋白或肽段的精准、稳定、可重复定量,一直是科学家关注的焦点。平行反应监测(Parallel Reaction Monitoring)PRM技术作为一种高特异性、高灵敏度、高通量的靶向质谱技术,正在逐步取代的SRM/MRM方法,广泛应用于生物标志物验证、临床研
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PRM (Parallel Reaction Monitoring, 平行反应监测) 是基于高分辨质诊技术的一种靶对性定量方法,已成为生命科学领域高级定量分析的重要工具。与经典的 SRM (选择反应监测) 相比,PRM定量蛋白质组学应用了 Orbitrap 或 TOF 类型质谱仪,对细分结构
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