资源中心

• • 什么是磷酸化蛋白质组学？

  磷酸化蛋白质组学是蛋白质组学的一个重要分支，专注于系统性研究细胞或组织中蛋白质的磷酸化修饰。磷酸化是最常见的一种翻译后修饰，指的是在激酶的作用下，将磷酸基团共价地添加到蛋白质的特定位点（如丝氨酸、苏氨酸或酪氨酸）上，从而调控蛋白质的活性、结构、定位或与其他分子的相互作用。通过高通量质谱分析结

• • Bottom-Up 蛋白质组学如何实现精确定量？

  Bottom-Up 蛋白质组学（也称分析型蛋白质组学）是一种主流的蛋白质组研究策略，指的是将复杂的蛋白质样本经过酶切（通常使用胰蛋白酶）分解为肽段后，再利用液相色谱-质谱联用技术（LC-MS/MS）对肽段进行鉴定与定量，从而推断原始蛋白质的信息。这种方法具有高通量、高灵敏度的特点，适用于复杂

• • Bottom-Up 方法在单细胞蛋白质组学中的挑战与机遇

  Bottom‑Up 蛋白质组学，也称为“shotgun proteomics”，是将蛋白质在体外酶解成肽段，然后通过液相色谱–质谱（LC–MS/MS）鉴定多肽，再推断原始蛋白质的方法。与 top‑down 方法直接分析完整蛋白不同，bottom‑up 更适合高通量鉴定，但仅覆盖蛋白片段信息。

• • Bottom-Up 蛋白质组学分析流程全攻略（附样本制备技巧）

  Bottom-Up 蛋白质组学（自下而上蛋白质组学）是一种研究蛋白质组的方法，它通过先将蛋白质酶解成较小的肽段，然后利用质谱（MS, Mass Spectrometry）等技术对这些肽段进行分析，以推断蛋白质的组成和特性。这是目前最常用的蛋白质组学策略之一。该方法以其高通量、灵敏度高和适应性

• • 高效处理 Bottom-Up 蛋白质组数据的6款核心工具推荐

  在 Bottom-Up 蛋白质组学（也称为“shotgun 蛋白质组学”）中，蛋白质样品经过酶切后以肽段的形式被分析，最终再推断出原始蛋白质。整个流程涉及质谱数据处理、肽段鉴定、蛋白质推断、定量分析等多个步骤。在Bottom-Up蛋白质组学中，数据分析的效率和准确性直接影响研究成果的深度和可

• • Top-Down蛋白质组学在肿瘤标志物发现中的五大应用

  肿瘤标志物作为癌症诊疗的重要分子指标，长期依赖传统蛋白组学技术的支持。然而，肿瘤本质上是一种高度异质性的疾病，其关键蛋白往往具有丰富的翻译后修饰（PTMs）和变异异构体（proteoforms）。这些精细分子特征常常在传统Bottom-Up蛋白质组学中被忽略，制约了肿瘤标志物的发现深度与精准

• • Bottom-Up 蛋白质组学原理

  Bottom-Up 蛋白质组学（Bottom-Up Proteomics）是目前最常用的蛋白质组学研究策略之一，其基本原理是通过将蛋白质样本酶解为肽段，然后利用质谱（Mass Spectrometry, MS）技术对这些肽段进行分析，从而推断原始蛋白质的种类与特征。Bottom-Up 蛋白质

• • N-糖与O-糖蛋白定量分析的流程对比与优化建议

  糖基化是真核蛋白质最广泛的翻译后修饰之一，深度参与细胞通讯、受体识别、免疫调节和肿瘤发生等过程。N-糖与O-糖作为两类核心修饰形式，虽同属糖基化范畴，但在修饰机制、结构多样性、分析策略方面存在显著差异。本文对两者在定量分析中的流程进行系统比较，并结合质谱技术发展，提出高效、精准的流程优化建议

• • 如何通过质谱实现糖肽结构的完整分析？

  糖肽（glycopeptides）作为连接糖链与肽链的复合分子，广泛存在于细胞膜蛋白、分泌蛋白和免疫相关蛋白中，对维持蛋白稳定性、调控信号通路及介导免疫识别具有重要作用。其复杂的结构构成对分析技术提出了极高要求。质谱，凭借其高灵敏、高分辨与分子级别解析能力，已成为糖肽结构研究的核心平台。本文

• • Bottom-Up蛋白质组学数据分析流程

  Bottom-Up蛋白质组学通过酶解蛋白质获得肽段，再经质谱鉴定与定量，最终反推蛋白质的种类与丰度。这一方法以其高通量、灵敏度高和适配性强等优点，广泛应用于生物标志物发现、疾病机制研究和药物开发等领域。以下是标准的Bottom-Up蛋白质组学数据分析流程。   一、样本准备与蛋白质酶解 Bo