抗原表位：揭开细胞死亡与癌症治疗新纪元的序幕
最近，在《自然》旗下的《细胞死亡与分化》杂志上，发表了一篇科学家找到触发细胞程序性死亡的开关的文章：美国加州大学戴维斯分校综合癌症中心的一个研究小组确定了CD95受体上一个可导致细胞死亡的关键表位。CD95受体（也被称为Fas）是一种位于细胞膜上的死亡受体，当被激活时，它们会释放出导致细胞自毁的信号。研究人员表示，他们找到了细胞毒性Fas信号以及CAR-T抗肿瘤功能的最关键表位。这可能会提供一条以肿瘤中的Fas为靶点的治疗途径。
抗原表位（antigenic epitope），也被称为抗原决定簇，是抗原分子上可以被特异性抗体识别和结合的化学官能团。每一个抗原可能含有多个不同的抗原表位，每个表位都可以与一个特异的抗体结合。抗原表位分析是一种用于确定抗体或T细胞受体识别的抗原分子上具体哪一部分（表位）的技术。这在疫苗设计、疾病诊断、免疫治疗以及基础免疫学研究中都是一个关键步骤。抗原表位可以是蛋白质或多肽的连续（线性）序列，也可以是由蛋白质折叠后空间上邻近的非连续氨基酸残基构成的构象表位。
图1
抗原表位分析在癌症治疗中的应用：
在癌症治疗中，抗原表位分析的重要性在于能够帮助识别那些可以成为免疫系统攻击目标的癌细胞特异性抗原。了解这些特异性表位对于设计靶向癌细胞的免疫疗法（如CAR-T细胞疗法、癌症疫苗）是至关重要的。
1.癌症疫苗开发：
通过分析表位来设计能够激活针对癌细胞的免疫反应的疫苗。
2.免疫检查点抑制剂：
发现可以增强免疫系统对癌细胞攻击的新表位，可能有助于设计更有效的免疫检查点抑制剂。
3.细胞治疗：
设计具有特异性T细胞受体的T细胞，这些T细胞能识别并靶向癌细胞的特定抗原表位。
传统的抗原表位分析方法是将蛋白质抗原降解为小片段，然后通过测序确定抗体的结合位点。其他技术，如ELISA法、噬菌体随机肽库、X-射线晶体学、核磁共振技术、氢氘质谱技术和生物信息学等也为表位分析提供了强大的工具。
基于质谱的蛋白测序技术是分析抗原线性表位的强有力方法，该方法还可用于通过探测具有高亲水性、表面可及性、灵活性和抗原性的区域来识别潜在的线性表位区域。
与线性表位相比，构象表位更难以绘制，氢氘交换质谱可以通过检测抗体结合对抗原蛋白氢氘交换速率的影响，从而鉴定出抗原的构象表位。在氢氘交换过程中，与抗体结合的抗原区域会因结合的遮蔽效应而显示出较慢的交换速率，通过对比抗原单独与D2O反应和抗原与抗体结合后与D2O反应的结果，可以确定哪些肽段的交换速率受到了抗体的影响，从而确定与抗体结合的抗原构象表位。
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