PLS-DA/OPLS-DA，怎么用s-plots筛选p<0.05?

当使用S-plots从PLS-DA或OPLS-DA模型中筛选 p 值小于 0.05 的变量时，可以遵循以下的一些步骤：

 

1.建立模型：

首先，需要在适当的统计软件或编程环境（如 R、MATLAB 或 Python）中完成 PLS-DA 或 OPLS-DA 分析。

 

2.生成S-plot：

使用分析工具，基于已建立的模型生成 S-plot。该图展示了变量的协方差和相关性系数。

 

3.识别显著变量：

在S-plot中，观察离群点，即远离原点的点。这些点代表了模型中对区分组别贡献最大的变量。

 

4.统计测试：

对这些显著变量进行统计测试（如t-test或ANOVA），确定其 p 值。

 

5.筛选变量：

从进行统计测试的结果中选择 p 值小于 0.05 的变量。

 

6. 验证所选变量：

选定变量后，建议进行交叉验证或使用独立数据集进行验证，以确保所选变量的可重复性。

 

通过这些步骤，可以有效地从PLS-DA或OPLS-DA模型中筛选出统计显著的变量，这些变量在生物标志物的发现或其他应用中可能具有重要价值。

 

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