怎么对蛋白胶条进行测定?
在蛋白胶电泳后,通常利用质谱技术进一步分析和表征特定的蛋白带,主要流程如下:
1.胶条切割:
从待测蛋白胶条中选择一均匀的部分或全长,避免选择有明显损伤或异常的部分。按照需要将蛋白胶条切成适当的尺寸。
2.蛋白消化:
将切割下来的胶块进行处理以使蛋白质还原和泛乙酰化,并使用特定的酶,如胰蛋白酶,进行消化,将蛋白质切割成较小的多肽片段。
3.质谱分析:
经消化的多肽被提取并通过液相色谱与质谱仪(LC-MS/MS)进行分析。质谱仪可以识别出这些多肽的质量和序列信息。
4.数据分析与蛋白质鉴定:
质谱数据通过生物信息学工具和蛋白质数据库进行匹配,实现原始蛋白质的定性定量确定。常用的软件有Mascot、SEQUEST、MaxQuant等。
5.验证:
有时,为了验证质谱的结果或进行定量分析,可以使用如Western Blotting的方法来进一步确认蛋白质的身份或表达水平 。
质谱分析能获取多种蛋白信息,包括分子量、氨基酸组成和序列、翻译后修饰情况以及含量等,不论是1D-SDS PAGE分离的蛋白胶条还是2DE PAGE中的蛋白胶点,都能利用质谱技术进行鉴定。
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