请问电泳出来的胶条去打质谱样品怎么处理呢？怎么酶切和除盐呢？

在电泳结束后，我们需要将电泳出来的胶条进行一系列处理才能用于质谱样品分析。下面是具体的步骤和方法：

 

一、电泳胶条处理

1、胶条切割

使用清洁的剪刀或刀片，尽可能将目标蛋白带切出来，尽量保持胶块体积小以便于后续的酶切和提取，具体尺寸可以根据实际需要进行调整。

 

2、胶块洗涤

将切割出来的胶块在50mM的氨基甲酸钠溶液中震荡洗涤，去除残留的SDS和染色剂；反复洗涤几次，直到洗涤液清澈无色。注意洗涤的温度应控制在冷却室温下，以防蛋白降解。

 

二、酶切

1、蛋白还原

使用DTT将胶块中的蛋白进行还原，通常使用的DTT浓度是10mM，并在56℃下孵育30分钟。

 

2、蛋白酶切

移除还原液后，加入酶切液（通常是Trypsin或其他蛋白酶），将蛋白进行酶切。酶切通常在37℃下进行，时间约为12-16小时。

 

三、除盐

1、超滤

将酶切后的样品通过超滤膜进行处理，以去除盐分和小分子杂质。选择适当的分子量截断（MWCO）膜。

 

2、固相萃取（SPE）

可以使用固相萃取柱进行进一步的纯化，去除盐分并浓缩肽段。选择合适的SPE柱进行操作。

 

以上就是电泳胶条的处理、酶切和除盐步骤，处理结束后，样品就可以用于质谱分析。

 

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