LC-MS/MS在抗体肽段测序中的应用与优势

抗体一级结构的准确解析在药物研发、功能研究与质量控制中具有重要意义。液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）技术凭借其高灵敏度、宽动态范围和对翻译后修饰的识别能力，已成为抗体肽段测序的关键工具，为抗体结构分析提供高通量、可重复的解决方案。

 

一、LC-MS/MS在抗体肽段测序中的技术流程概述

抗体测序通过质谱手段对蛋白质进行酶解、分离、碎裂及数据分析，获得氨基酸序列信息。主要步骤包括：

• 酶解处理：将抗体切割为适宜分析的小肽段，增强质谱解析覆盖率；

• 色谱分离：通过液相色谱对肽段混合物进行梯度分离，减少信号干扰；

• 串联质谱分析：在MS/MS模式下获取肽段碎片离子信息，用于序列反推；

• 数据解析：结合数据库比对与去新测序（de novo）方法完成序列重构。

 

整个流程无需已知序列背景，适用于广泛来源和结构类型的抗体样本。

 

二、LC-MS/MS在抗体测序中的技术优势

1、高序列覆盖率

LC-MS/MS可实现对抗体重链与轻链的高覆盖率测定，尤其对高变区（CDR）区域具备较强解析能力，有助于揭示关键结构差异。

 

2、翻译后修饰识别能力强

质谱技术可精确检测诸如氧化、去酰化、糖基化等翻译后修饰，提升对抗体功能状态与稳定性的理解。

 

3、支持未知抗体的去新测序

无需参考序列即可实现从头拼接，适用于序列未公开或来源不明的抗体样本，拓宽抗体结构研究范围。

 

4、适用于一致性评估与变异检测

通过质谱图谱比对可检测抗体批次之间的结构差异、修饰偏移或表达体系引起的变化，增强工艺可控性。

 

5、灵活适配多类型抗体结构

LC-MS/MS适用于各类抗体形式，包括全长抗体、抗体片段及构建体复杂的工程抗体，具备良好通用性。

 

三、LC-MS/MS在抗体研发中的应用场景

LC-MS/MS在抗体药物开发的多个阶段均有广泛应用，涵盖从筛选到质量管理的各个关键环节：

• 序列确认：用于验证表达抗体是否与预期序列一致，防止突变引入；

• 结构比对：比较不同样本中抗体结构的一致性，用于稳定性评估；

• 变异与修饰监测：识别轻微的氨基酸替换及PTMs，确保功能不受影响；

• 去新测序应用：对缺乏公开信息的抗体分子进行结构拼接，适用于基础研究和差异化研发；

• 质量控制支持：为生产工艺放大与药品申报提供分子层面的结构依据。

LC-MS/MS具备的高分辨率与可重复性，使其成为抗体结构分析的重要技术路径。

 

LC-MS/MS作为抗体肽段测序的核心技术手段，已在抗体研究与开发的多个环节中发挥关键作用。其在序列解析、修饰识别、一致性评价等方面的综合优势，使其成为当前抗体结构表征的重要平台。在抗体药物日益复杂、结构要求日益严格的背景下，选择具备专业技术能力与高质量交付标准的服务团队，是保障项目进展与数据合规的关键。百泰派克生物科技专注于高分辨率质谱分析，期待为您的抗体研发项目提供可靠的数据支持与技术保障。

 

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