请问对已知氨基酸序列，怎么确定（预测）它的磷酸化位点（丝氨酸、酪氨酸、苏氨酸）和糖基化位点？

对于已知的氨基酸序列，确定或预测蛋白质中的磷酸化位点（丝氨酸、酪氨酸、苏氨酸）和糖基化位点通常依赖于生物信息学工具和实验方法。：




1、生物信息学预测：

• 使用专门的生物信息学软件和数据库，如 PhosphoSitePlus、NetPhos、KinasePhos 用于磷酸化位点预测。
• 对于糖基化位点，可以使用 NetNGlyc（N-糖基化位点预测）和 NetOGlyc（O-糖基化位点预测）等工具。



这些工具基于已知的磷酸化和糖基化位点的模式和序列特征，通过算法来预测潜在的修饰位点。




2、质谱分析：

• 蛋白质样品可以通过质谱（MS）分析来确定磷酸化和糖基化位点。
• 在质谱实验中，蛋白质首先被酶切成肽段，然后通过质谱分析来识别修饰的氨基酸残基。由于磷酸化和糖基化会改变肽段的质量，通过比对修饰前后的质量变化可以准确地识别修饰位点。



百泰派克生物科技--生物制品表征，多组学生物质谱检测优质服务商




相关服务：

磷酸化定量蛋白组学研究

糖基化定量蛋白组学研究

酪氨酸磷酸化定量蛋白组分析

多通路磷酸化蛋白质组学

翻译后修饰蛋白组分析

组蛋白翻译后修饰分析