请问非变性凝胶电泳可以使互作蛋白复合物分开吗？比如复合物AB跑完胶以后，出现其中一个蛋白A的条带？

非变性凝胶电泳并非旨在分离互作蛋白复合物，但在某些特定条件下，仍有可能实现复合物AB的分离。

非变性凝胶电泳的主要原理是蛋白质在电场中随电荷和大小而分离。复合物是否能够在非变性凝胶电泳中分离取决于一些因素，如蛋白质间的相互作用强度、复合物的稳定性、蛋白质分子的大小与电荷等。如果蛋白质间的相互作用较弱，电泳过程可能导致复合物破裂，并在胶上形成单个蛋白质的条带。然而，如果相互作用较强，则复合物在胶上可能保持结合，不能分离。

如果你的目标是破坏复合物，并在凝胶上观察到每个单独的蛋白质，更适合采用变性凝胶电泳（如SDS-PAGE）。在这种方法中，蛋白质与SDS及其他变性剂结合，使复合物破裂同时阻止其重新结合，如此一来蛋白质在胶上分离成各自的条带。您还可以尝试使用更弱的分离条件（如减少电泳时间、改变缓冲体系等），从而提高非变性凝胶电泳中蛋白质复合物的分离效果。