TMT标记定量蛋白组学
TMT标记定量蛋白组学定义
定量蛋白质组学技术主要分为标记和非标记(Label Free)两类,标记定量蛋白技术又分为体内标记和体外标记两种。TMT(Tandem Mass Tag)是一种体外肽标记技术,TMT标记定量蛋白组学即利用TMT技术对一个生命体或组织的基因组所表达的全部蛋白质或一个混合体系中所有的蛋白质进行精确的定性和定量鉴定,以揭示生命体某项生命活动过程中蛋白质的变化。
TMT标记定量蛋白组学研究方法
TMT试剂标签由氨基反应基团、质量报告基团和质量平衡基团三部分组成,氨基反应基团能特异性识别多肽N末端和赖氨酸侧链基团并发生共价结合,实现同位素标记;质量报告基团和质量标准化基团各有10种不同的分子量,使得一级质谱中被TMT标记的不同来源的同一肽段表现出相同的质荷比,在二级质谱中,可通过剪切断裂释放出TMT报告离子,由此得到离子峰强度与离子峰质荷比,通过软件结合相应数据库对离子峰强度和质荷比值进行分析,可以计算样品蛋白的含量。
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