DIA定量蛋白组学
目前定量蛋白质组学研究可以分为传统的基于DDA的蛋白质定量策略、基于MRM/SRM/PRM的靶向蛋白质定量策略以及基于DIA的蛋白质定量策略。基于DDA的蛋白质定量策略如Label Free、iTRAQ、TMT和SILAC等利用液相色谱串联质谱技术(LC-MS/MS)可以对成百上千种蛋白质进行检测和相对/绝对定量,这些方法基于DDA数据依赖采集模式来采集质谱数据,数据缺失较多、重复性低、定量数据不精准,难以检测到低丰度的蛋白。
基于MRM/SRM/PRM的靶向蛋白质组学定量策略是质谱绝对定量的金标准,可以对蛋白质进行精确的绝对定量,但是检测通量较低,通常只能鉴定几十到上百个目标蛋白,无法开展高通量的蛋白质精确定量。
近几年发展起来的DIA蛋白质组学基于全息式采集模式的质谱技术实现蛋白质的精确定量,完美的结合了DDA技术的高通量和靶向定量蛋白质组学技术高精确的特点,在高通量定量的基础上也保证了定量结果的准确性。DIA定量蛋白质组学技术(如SWATH)将质谱整个扫描范围分成不同的小窗口,并对每个窗口中的全部母离子进行循环检测,理论上可无偏向性的获取所有母离子的全部碎片信息,数据利用度高且重复性好,是定量蛋白质组学研究中的重要工具。
百泰派克生物科技采用AB SCIEX Triple-TOF 5600 plus高分辨质谱系统结合nanoLC-MS/MS纳升色谱,提供高分辨率、高准确度的DIA定量蛋白质组学一站式服务技术包裹,您只需要将您的样品寄给我们,我们会负责项目后续所有事宜,包括蛋白提取、蛋白酶切、肽段分离、质谱分析、质谱原始数据分析、生物信息学分析,欢迎免费咨询。
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