绝对定量(aqua)蛋白质组学

定量蛋白质组学是一种强大的方法，用于发现和靶向蛋白质组学分析，以了解细胞、组织或生物体中的全部蛋白质组学动态。大多数定量蛋白质组分析需要实验组中蛋白质或肽的同位素标记，然后可以通过质谱法进行区分。基于质谱的蛋白质定量方法可以分为相对定量和绝对定量两种。相对定量方法（SILAC、ICAT、ICPL和等压标签）用于比较样品之间的蛋白质或肽丰度，而具有已知同位素标记合成肽浓度的未标记样品可以通过选定的反应监测（SRM）产生目标肽进行绝对定量，利用绝对定量策略进行蛋白质组含量研究就称为绝对定量蛋白质组学。无标记策略也可用于相对和绝对定量。虽然这些策略比单纯的蛋白质鉴定更复杂，但定量蛋白质组学对于我们理解全部蛋白质表达、生物过程和疾病状态的分子机制背后的修饰至关重要。

绝对定量是一种有针对性的定量蛋白质组学技术，具有强大的功效，并且越来越多地用于各种定量蛋白质组学研究，如用于蛋白质及其修饰状态的绝对定量（AQUA）。蛋白质绝对定量策略的原理是以已知浓度的肽或掺入的稳定同位素合成作为理想的内部标准，以模仿由蛋白水解形成的天然肽，这些合成肽也可以用共价修饰（例如，磷酸化，甲基化和乙酰化等）制备，这些修饰在化学上与天然存在的翻译后修饰相同。然后，使用这种AQUA内标肽，通过利用串联质谱仪中选定的反应监测分析，精确定量地测量蛋白水解后蛋白质和翻译后修饰蛋白质的绝对水平。

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