药物开发和生物制品表征:质谱流式可检测的细胞指标:RNA和蛋白质的编码检测-百泰派克生物科技BTP

    质谱流式技术(Mass Cytometry)在药物开发和生物制品表征中的潜力巨大。质谱流式细胞术将质谱技术与流式细胞仪相结合,能够实现对单个细胞的生化成分进行深入研究,帮助我们理解疾病机制,验证药物的效果,发现新的药物靶点以及增强生物制药质量控制。这在生物制品表征中非常有用,它可以帮助解决以下一些问题:

     

    单细胞层次的分子表征:传统的质谱技术通常需要大量的样本以获取可靠的结果,而质谱流式技术则可以分析单个细胞的生化成分,这可以帮助我们更深入地理解细胞的生物学特性。

    生物分子的定量分析质谱流式技术可以对细胞内的生物分子进行定量分析,包括蛋白质、代谢物和其他生物分子。

    细胞异质性的研究细胞群体中的细胞并非完全相同,它们之间的差异可能影响疾病的发展和治疗的效果。质谱流式技术可以帮助我们研究这种细胞异质性。

     

    百泰派克生物科技BTP采用基于Fluidigm Helios流式细胞仪(Mass Cytometry System for Single Cell Analysis)用于单细胞质谱分析,该平台能够完成包括单细胞捕获、cDNA合成、实时定量PCR分析、目标区域扩增以及质谱流式细胞分析。

     

    相比于传统荧光流式,质谱流式的检测指标完成了从荧光标签到金属标签的巧妙转换。检测维度的递增代表了一种突破性的进展,这使得质谱流式具有独特的优势,目前,使用质谱流式技术可以同时对多达45个参数进行可靠的量化。理论上,质谱流式能同时对100多种元素进行检测,这表明在未来的应用中具有更高的复用能力,这使得质谱流式能够更全面的方式对细胞进行分析。

     

    目前质谱流式可检测的细胞指标可分为12类,2020年有一篇综述全面的总结了质谱流式的应用领域。

     

    为了能够在单细胞分辨率下对RNA和蛋白质特征进行编码检测,Frei等人开发了PLAYR(proximity ligation assay for RNA),这是一种进行高度多重转录物定量的方法。当与质谱仪一起使用时,PLAYR允许对40多种不同的mRNA和蛋白质同时进行定量。PLAYR采用成对的DNA寡核苷酸探针,包括一个区域与目标转录物杂交,另一个区域作为模板与另外两个寡核苷酸结合并环化,通过滚动循环扩增进行连接和放大。每个探针对的扩增产物都用标记有质量标签的寡核苷酸来检测。另一种基于质谱流式的新型mRNA转录物和蛋白质编码检测方法,称为金属原位杂交(MISH),是通过结合CyTOF和RNAscope平台开发的。该技术通过杂交RNA特异性探针和与放大的序列靶向金属标记的探针结合实现信号放大。

     

    PLAYR和MISH都与常规免疫染色兼容,同时进行的转录物定量数量只受限于可与寡核苷酸连接的报告基团的数量。值得注意的是,在这两种方法中,RNA的测量将占据金属通道,这意味着同时编码检测的RNA和蛋白质目标的总数取决于金属质量通道的数量(目前最多为45个)。Frei等人给出了一个蛋白质和转录物的同时多重分析的例子。他们用PLAYR监测脂多糖刺激后PBMCs中8个细胞因子转录物和18个蛋白表位的诱导,并揭示了每个细胞的功能能力和其蛋白标记物表达之间的相关性。

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    关于我们

     

    百泰派克生物科技-生物药物表征,生物质谱多组学优质服务商

     

    北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 简称BTP)从事以生物质谱为依托的生物药物表征,大分子物质(包括蛋白质、多肽、代谢物)质谱分析以及小分子物质检测服务。

    1、公司采用ISO9001质量控制体系,专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务;

    2、获国家CNAS实验室认可,为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务;

    3、业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等;

    4、七大质量控制检测平台,满足您一站式服务需求;

    5、服务3000+企业,10000+客户的选择;

    6、致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

     

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    相关服务

    单细胞质谱流式技术分析

     

    参考文献:

    [1] Zhang T, Warden AR, Li Y, Ding X. Progress and applications of mass cytometry in sketching immune landscapes. Clin Transl Med. 2020 Oct;10(6):e206. doi: 10.1002/ctm2.206. PMID: 33135337; PMCID: PMC7556381.

     

     

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