蛋白组学定量原理
蛋白组学定量是蛋白质组学研究的重要组成部分,主要通过比较不同样本中蛋白质的质量或数量差异,揭示蛋白质在生命活动中的作用和功能。蛋白组学定量方法主要包括相对定量和绝对定量两种。
一、相对定量
相对定量是指通过比较不同样品中同一种蛋白质的丰度,反映其在不同条件下的相对变化。比如,通过比较病人组和健康组的样品,可以发现某种蛋白质在病人组样品中的丰度较高,可能这种蛋白质与疾病有关。目前常用的相对定量方法有标记法和标记-后定量法。
1.标记法
在样品制备阶段就引入化学标签,如同位素标签,然后再进行质谱分析,根据标签的质量差异进行定量。常用的标记法有ICAT、iTRAQ和TMT等。
2.标记后定量法
在质谱数据分析阶段进行定量,如标记-后定量法(Label-free),这种方法无需进行样品上的任何修改,是一种非标记方法。
二、绝对定量
绝对定量是指测定样品中某种蛋白质的绝对含量,这种方法需要用到已知浓度的标准品,根据标准品的信号强度,推算样品中蛋白质的绝对含量。常用的绝对定量方法有AQUA和QconCAT等。
蛋白组学定量是一种动态的、全面的研究方法,通过它可以了解蛋白质在不同环境、不同组织、不同疾病状态下的表达差异。
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