百泰派克生物科技BTP客户案例:利用蛋白质谱鉴定对多粘类芽孢杆菌KF-1分泌的半纤维素降解酶进行分析鉴定

    20230310-2776-mceu_89081772381678433436176.png

    期刊:Catalysts;影响因子: 4.6407

    原文链接:DOI: doi.org/10.3390/catal8120589

    研究对象:多粘类芽孢杆菌

    研究目的:多粘类芽孢杆菌中的半纤维素降解酶研究

    研究手段:蛋白质谱鉴定等

    研究内容及结论:多粘类芽孢杆菌具有显著的半纤维素降解活性。该研究通过LC-MS/MS分析,从多粘芽孢杆菌P. polymyxa KF-1分泌的蛋白质组中鉴定出13种半纤维素降解酶。根据活性测定,P. polymyxa表现出木聚糖内切酶、β-甘露糖苷酶、β-木糖苷酶,α-半乳糖苷酶和α-L-Af活性,其中α-L-Af活性最高。从酶提取物中鉴定出四种预测为Af的蛋白,其中2个归类于GH43,另外2个归类于GH51 α-N-阿拉伯呋喃糖苷酶。该研究克隆和表达了一个新的属于GH51的α-L-阿拉伯呋喃糖苷酶,PpAbf51b。重组PpAbf51b在大肠杆菌BL21(DE3)中被生产出,凝胶过滤层析发现其为四聚体。实验发现,PpAbf51b在pH值6.5和40℃时最活跃,但在较宽的pH范围内(pH 4.0-11.0)均表现稳定。PpAbf51b特异水解含有中性阿拉伯糖的多糖,包括甜菜阿拉伯聚糖、linear-1,5-L-阿拉伯聚糖、小麦阿拉伯木聚糖,主要产物为L-阿拉伯糖。水解产物表明,PpAbf51b具有exo-α-L-阿拉伯呋喃糖苷酶的功能。此外,研究还发现PpAbf51b与长枝木霉(Trichoderma longibrachiatum)endo-1,4-木聚糖酶结合,对小麦阿拉伯木聚糖的降解具有显著的协同作用。综上,本研究从多粘类芽孢杆菌KF-1的分泌物中鉴定出一种新的α-L-阿拉伯呋喃糖苷酶,且该酶具有应用于生物技术产业的潜力。

    20230310-0484-mceu_27631904191678433454998.png

    利用LC-MS/MS技术P. polymyxa KF-1分泌的半纤维素降解酶进行分析鉴定,该服务由北京百泰派克生物科技提供。分泌蛋白组学分析鉴定出13个蛋白质属于半纤维素降解酶,4个木聚糖酶属于GH10和GH11家族,4个GH43酶,2个GH51家族的具有α-L-AF_C超家族结构域的α-N-阿拉伯呋喃糖苷酶,1个GH27α-半乳糖苷酶和1个GH44 β-甘露糖苷酶。为后续克隆和鉴定PpAbf51b提供了基础。

     

    参考文献:Hu Y, Zhao Y, Tian S, et al. Screening of a novel glycoside hydrolase family 51 α-L-arabinofuranosidase from Paenibacillus polymyxa KF-1: cloning, expression, and characterization[J]. Catalysts, 2018, 8(12): 589.

     

    百泰派克生物科技-您身边的生物质谱专家

    北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 简称BTP)从事以生物质谱为依托的生物药物表征,大分子物质(包括蛋白质、多肽、代谢物)质谱分析以及小分子物质检测服务。公司采用ISO9001质量控制体系,专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务,业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等。7大质量控制检测平台,服务3000+企业,10000+客户的选择,致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

     

    相关服务:

    蛋白质质谱鉴定

    蛋白质组学分析

提交需求
姓名 *
联系类型 *
联系方式 *
项目描述
咨询项目 *

 

How to order?


https://file.biotech-pack.com/static/btpk/assets/images/icon/icon-rc2.png

客服咨询

https://file.biotech-pack.com/static/btpk/assets/images/icon/icon-message.png

提交需求

https://file.biotech-pack.com/static/btpk/assets/images/icon/icon-wx-2.png

https://file.biotech-pack.com/pro/bt-btpk/image/head/config/20240104-5618-企业微信销售二维码.jpg

联系销售人员

https://file.biotech-pack.com/static/btpk/assets/images/icon/icon-tag-sale.png

促销活动

https://file.biotech-pack.com/static/btpk/assets/images/icon/icon-return.png