MRM靶向定量蛋白质组学用于评估PROTAC效力

一、PROTAC：从“抑制”到“降解”的药物新范式

与传统小分子抑制剂不同，PROTAC（Proteolysis Targeting Chimera，蛋白降解靶向嵌合体）通过招募E3泛素连接酶，实现对靶标蛋白的泛素化并诱导其在细胞内被蛋白酶体降解。这种“去除而非抑制”的机制，为“不可成药”靶点（如转录因子、scaffold蛋白等）提供了全新的药物开发策略。

 

在PROTAC分子的开发过程中，如何准确评估其对靶标蛋白的降解能力，是药效优化和结构迭代的核心问题。而这正是靶向蛋白质组学，特别是 MRM（Multiple Reaction Monitoring）定量技术展现巨大价值的地方。

 

二、为什么MRM适用于评估PROTAC？

MRM是一种基于三重四极杆质谱（Triple Quadrupole, QqQ）的靶向蛋白定量方法，因其出色的灵敏度、特异性和重现性，已广泛应用于生物标志物验证、临床样本分析等场景。在PROTAC研究中，MRM凭借其定量精度和高通量能力，逐渐成为药效评估的标准工具

 

三、MRM在PROTAC效力评估中的三大核心优势

1、精准量化靶标蛋白降解程度

通过设计靶蛋白的特异性肽段及其对应的MRM转itions（指在三重四极杆质谱中监测的母离子-碎片离子对），可实现fmol级别的定量灵敏度，从而精确捕捉蛋白在PROTAC处理前后的动态变化。

 

2、并行分析多条件下的降解效率

MRM可高效支持多个时间点、剂量梯度、候选PROTAC分子在同一批次中并行检测，适用于快速构建降解曲线并筛选结构优化方向。

 

3、联合检测下游信号蛋白，评估功能影响

除了靶蛋白本身，MRM还可覆盖关键通路蛋白（如转录调控因子、磷酸化蛋白等），帮助研究者全面评估蛋白降解对细胞功能及信号通路的影响。

 

四、相较Western blot，MRM的优势在哪里？

 



 

MRM在准确性、可扩展性和实验效率方面均优于Western blot，尤其适用于药物开发中高通量靶点评估的需求。

 

总结：MRM让PROTAC研发更可量化、更可控

在PROTAC这一新兴药物策略中，精确评估蛋白降解效力是连接“结构”与“功能”的关键环节。MRM靶向定量蛋白质组学凭借其卓越的灵敏度、通量与重现性，正在成为药效评估和候选分子筛选的标准工具。百泰派克生物科技拥有成熟的MRM定量平台和丰富的PROTAC项目经验，能够为您提供从肽段筛选、方法开发到样本检测的“一站式”定制服务，助力新药开发更快更稳推进。

 

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