什么是靶向定量蛋白质组学?

    “靶向定量蛋白质组学”(Targeted Quantitative Proteomics)是一种高灵敏度、高特异性的蛋白质组分析策略,广泛应用于生物标志物验证、疾病机制研究、药效学评估和质量控制等领域。相比发现型(Discovery)蛋白质组学,靶向定量强调对特定目标蛋白进行精准、重复性强的定量分析

     

    本文将从基本原理、主流技术平台、实验流程到典型应用,系统梳理靶向定量蛋白质组学的核心内容,帮助研究人员科学选择合适的技术方案。

     

    一、什么是靶向定量蛋白质组学?

    靶向定量蛋白质组学以预选的蛋白或肽段为对象,通过设定特定的离子转移通道或全产物离子扫描策略,获取目标的定量信息。其特点包括:

    1、明确靶点(目标蛋白或肽段)

    2、使用标准品或内标进行定量校正

    3、重复性强,适合临床与大样本研究

    4、检测灵敏度远高于发现型蛋白组

     

    二、主流技术平台

    1、MRM/SRM(Multiple/Selected Reaction Monitoring)

    (1)仪器平台:三重四极杆质谱(Triple Quadrupole)

    (2)原理:选择特定前体离子 → 诱导断裂 → 检测特定产物离子

    (3)特点

    • 高通量、低背景干扰

    • 适合数十~数百个靶点的定量

    • 与代谢组学中MRM思路一致

     

    2、PRM(Parallel Reaction Monitoring)

    (1)仪器平台:高分辨率质谱(如Orbitrap、Q-TOF);

    (2)原理:选择前体离子 → 同时记录所有产物离子

    (3)特点

    • 精准度更高,特异性更强

    • 适合复杂背景中的靶点识别

    • 可应用于验证阶段或临床样本

     

    3、DIA-based靶向方法

    (1)趋势:整合高分辨DIA(Data-independent acquisition)技术,通过内标引导实现高效靶向分析

    (2)优势

    • 提高多肽覆盖度

    • 适合多样本高通量定量

     

    三、靶向定量蛋白质组与发现型蛋白组的对比

     

    targeted-proteomics-analysis-zh1-1

     

    四、靶向定量蛋白质组学实验流程概览

    1、靶点筛选与肽段设计

    • 来源于前期DIA分析、文献报道、数据库(如PeptideAtlas)

    • 筛选稳定、特异、离子化效率好的肽段作为定量单位

     

    2、标准品合成(可选)

    合成稳定同位素标记肽(SIS)用于绝对定量

     

    3、样本前处理

    蛋白提取 → 酶解 → 净化 → 加入内标

     

    4、质谱分析

    根据项目选择MRM或PRM

     

    5、数据处理与定量分析

    Skyline、SkyQuant、Scaffold DIA等专业软件

     

    五、靶向定量蛋白质组学的应用场景

    1、生物标志物验证

    在肿瘤、自身免疫病、感染性疾病等研究中,MRM/PRM常用于验证前期筛选出的候选蛋白,支持转化医学研究。

     

    2、药效学与毒理学评估

    监测药物干预前后特定蛋白的表达变化,评价药物靶点、作用通路是否被调控。

     

    3、合成生物学与蛋白表达优化

    在细胞工厂构建过程中,对关键酶蛋白的表达水平进行定量,优化表达效率。

     

    4、质量控制与批间一致性检测

    在生物制品生产(如抗体、重组蛋白)中监测特定杂质蛋白或功能位点表达。

     

    在靶向定量蛋白质组学领域,百泰派克生物科技整合高灵敏三重四极杆质谱平台高分辨Orbitrap平台,可提供包括MRM、PRM、内标定量在内的多种服务形式:

    • 个性化靶点设计服务:支持文献挖掘、DIA数据整合、靶点筛选

    • 高质量稳定同位素标记肽定制

    • 标准化数据处理流程,保证结果一致性与可比性

    • 支持从发现型蛋白组到靶向验证的全流程服务

     

    靶向定量蛋白质组学是从“广撒网”到“精准打击”的关键一步,它在疾病机制研究、临床转化和生物制药中的价值不断提升。通过选择合适的技术平台(MRM或PRM)和优化实验设计,科研人员可以实现对目标蛋白的灵敏、稳定和可重复检测。

     

    百泰派克生物科技--生物制品表征,多组学生物质谱检测优质服务商

     

    相关服务:

    靶向蛋白质组学

提交需求
姓名 *
联系类型 *
联系方式 *
项目描述
咨询项目 *

 

How to order?


/assets/images/icon/icon-rc2.png

客服咨询

/assets/images/icon/icon-message.png

提交需求

https://file.biotech-pack.com/static/btpk/assets/images/icon/icon-wx-2.png

https://file.biotech-pack.com/pro//bt-btpk/20241231/config/1874015350579343360-WX-20241231.jpg

联系销售人员

/assets/images/icon/icon-tag-sale.png

促销活动

/assets/images/icon/icon-return.png