用于药物发现的泛素化通路

    泛素-蛋白酶体系统(ubiquitin–proteasome system, UPS)是细胞内关键的蛋白质稳态调控机制。通过E1、E2、E3以及去泛素化酶(DUBs)参与,泛素化修饰影响蛋白质的稳定性、活性、定位和降解。这一过程不仅参与信号传导、自噬和DNA修复,更与癌症、神经退行性疾病、免疫调节等多个病理过程密切相关。在新药研发领域,泛素化通路的作用已从“基础调控”转变为“关键靶点”。科研界正通过小分子抑制剂和靶向蛋白降解技术(如PROTAC和分子胶)探索如何干预泛素化过程,从而开发出新一代治疗癌症、炎症及神经疾病的精准药物。用于药物发现的泛素化通路不仅扩展了传统小分子药物的作用范围,也为“不可成药靶点”提供了全新突破口。

     

    一、E3泛素连接酶 & DUBs:调控核心与临床潜力

    1、E3连接酶:底物特异性识别者

    E3连接酶负责识别特定底物并与E2联合,将泛素链接写入底物蛋白上。人体约700余种E3,展现出高度特异性。药物开发中典型策略包括:

    (1)CRBN/SCF家族:小分子(如沙利度胺、来那度胺)诱导CRBN识别IKZF1/3等转录因子,实现其泛素化降解,被批准用于多发性骨髓瘤治疗。

    (2)MDM2–p53路径:MDM2对p53的泛素化降解被认为是肿瘤抑制机制的关键,MDM2抑制剂可恢复p53功能。

     

    2、DUBs:泛素“擦除者”的双刃剑

    DUBs剪切蛋白上的泛素链,可稳定或激活靶蛋白。像USP7、USP15、OTUD3等在癌症、免疫与肝癌进展中扮演重要角色。

    (1)USP7抑制剂:FT827、XL177A等小分子已成功开发,用于阻断USP7–MDM2–p53通路。

    (2)USP15调控cGAS路径:其在天然免疫启动中发挥正反馈机制,揭示DUB作为免疫调节靶点的新策略。

     

    二、靶向蛋白降解技术:PROTACs 与分子胶革新药物策略

    1、PROTACs:异构小分子连接器

    PROTAC(Proteolysis Targeting Chimera)由三部分组成:一个靶蛋白的结合域、一个E3连接酶配体,以及连接二者的linker。它通过诱导靶蛋白–E3三元复合体,实现靶蛋白的泛素化和24S蛋白酶体降解。

    (1)临床进展:Arvinas公司ARV-110(雄激素受体降解剂)、ARV-471(雌激素受体降解剂)、ARV-766等已进入临床。

    (2)新策略:蛋白肽PROTACs兼具可降解性与结构灵活性,成本低、靶向更广。

    (3)设计参数:三元结构的稳定性、细胞内参数(如E3配体可用性、靶蛋白表达等)决定降解效率。

     

    2、分子胶(Molecular Glue):单体诱导多聚降解因子

    分子胶为单功能小分子,通过增强E3与靶蛋白的相互作用,实现泛素化。例如,lenalidomide等可将CRBN与IKZF1/3牵引,从而降解这类蛋白。其分子量更小、渗透性更佳,更具临床开发潜力。

     

    百泰派克启动化学生物学平台,结合FUSEP及其他探针,可锁定新型E3–靶蛋白界面,发现下一代分子胶候选分子。

     

    三、药物发现策略:从筛选到临床转化

    1、高通量筛选与结构引导优化

    片段筛选(FBDD)适用于E1/E2/E3及DUB靶点,通过X射线或NMR辅助设计小分子引物。对PROTAC/分子胶类药物而言,结构与细胞效果的优化需同步进行。

     

    2、AI 辅助设计

    近期研究显示:图神经网络(GNN)与生成模型已被用于预测PROTAC设计与优化路径,加速药物发现流程。

     

    3、联用策略与治疗窗口

    当前临床研究表明,通过PROTAC或分子胶联合标准小分子、免疫疗法或靶向治疗,可以克服耐药机制,实现协同增强。

     

    泛素化通路为药物发现开拓了跨越“不可抑制靶点”的新维度。从E3、DUB到PROTAC与分子胶,均处于科技前沿。百泰派克生物科技长期以来专注于建立 蛋白质组+代谢组+AI+结构生物学 的整合平台,提供精准靶点发现与验证;高通量筛选与候选化合物优化;AI辅助分子设计与多组学联合评价,助力科研团队与企业客户,高效推进泛素化靶点药物从早期发现到临床前候选药的全流程。

     

    百泰派克生物科技——生物制品表征,多组学生物质谱检测优质服务商

     

    相关服务:

    泛素化定量蛋白组学研究

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