蛋白质谱图鉴定

蛋白质质谱分析中，样本蛋白经过蛋白酶水解后成肽段，经过一维或者多维的色谱法分离，之后肽段被电离和被碎裂形成特征串联质谱谱图，利用自动数据比对程序，将质谱谱图转变成肽段序列。然后对肽段组装和拼接进行验证，将错误的肽段信息滤除，已经被鉴定的肽段序列用来推断样本中有哪些蛋白，当然一些肽段序列可能出现在不止一个蛋白中，这也会使推断过程更加复杂。

在常规的蛋白质谱实验中，蛋白质谱图鉴定可通过搜库的方式来处理，可采用计算机软件和数据库对产生的谱图进行自动化比对翻译出检测样本中的肽段序列。通常搜库分为三类，第一类是不需参考任何数据库的直接将谱图转换为肽段，即蛋白de novo测序法。第二类是将实验谱图与数据库理论谱图进行比对分析，从数据库中获取肽段。第三类是一种混合搜库方法，即部分蛋白序列进行比对分析，是一种具有容错率较高的数据比对方法。目前较为主流的搜库方法是将实验谱图与数据库理论谱图进行比对来获取肽段序列。

完成蛋白质肽段检测后，需要结合可信度、打分等指标来分析蛋白质最终质谱检测结果，通常情况下，可利用打分机制来比对谱图之间相似度，候选肽段可通过计算机打分进行排列，打分最高序列被认为是最为匹配和相似的肽段序列，基于此序列可进行下一步分析。

百泰派克生物科技采用Orbitrap Fusion质谱平台，Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，能够对各种样品中的蛋白质进行高效精准的蛋白质肽谱图鉴定服务以及蛋白组学相关服务。您只需要将您的需求和样品寄给我们，我们会负责项目后续所有事宜，包括样品前处理、质谱分析、质谱原始数据分析和组学分析。