蛋白质翻译后修饰分析概述
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磷酸化(Phosphorylation):发生在Ser、Thr、Tyr残基,是信号转导通路的核心调控机制;
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乙酰化(Acetylation):常见于赖氨酸残基,参与染色质重构与转录调控;
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泛素化(Ubiquitination):通过连接泛素多聚链决定蛋白质降解或功能调节;
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甲基化(Methylation):影响基因表达、表观遗传状态;
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糖基化(Glycosylation):关键于细胞间识别、蛋白质稳定性与免疫调控;
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硝化、羟基化、棕榈酰化、硫酸化等:涉及线粒体功能、受体激活、蛋白质膜锚定等多方面调控。
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磷酸化肽可用TiO₂或Fe-NTA柱富集;
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泛素化残基可通过K-ε-GG抗体识别特异性标记;
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乙酰化肽常用抗体免疫沉淀或强阳离子交换色谱(SCX)富集。
蛋白质是生命活动的执行者,从信号转导到细胞结构维持无所不在。但蛋白质在翻译完成后,并非立即具备生物活性,它们通常需要经历一系列“翻译后修饰”(Post-Translational Modifications, PTMs),才能实现功能激活、亚细胞定位调整或降解控制。这些修饰赋予蛋白质更丰富的功能层次,是细胞精密调控的关键方式。深入分析蛋白质的翻译后修饰,不仅是基础生命科学研究的核心任务,也是疾病机制揭示与靶点发现的关键途径。
一、蛋白质翻译后修饰的多样性与功能意义
蛋白质翻译后修饰是在蛋白质合成后,通过酶促或非酶促方式引入化学基团或结构改变的分子事件。目前已鉴定的PTM种类超过400种,最常见的包括:
这些修饰广泛分布于哺乳动物、植物、微生物等不同生物体,参与细胞周期、代谢稳态、应激反应乃至病理状态(如肿瘤、自身免疫疾病、神经退行性疾病)的调控网络。
二、翻译后修饰研究的分析策略
当前,质谱技术(Mass Spectrometry, MS)无疑是PTM研究的核心平台。基于高分辨率质谱的蛋白质组学方法,能够在不依赖抗体的前提下,实现对全局修饰位点的高通量、定量识别。其基本流程包括:
1、蛋白提取与酶解
通常使用胰蛋白酶将复杂样本中的蛋白质切割为肽段,以暴露潜在的修饰位点。为了提高修饰肽的检出率,需特别优化裂解条件,避免修饰丢失。
2、富集修饰肽段
由于修饰肽段丰度低、信号弱,必须通过特异性富集手段进行前处理。例如:
3、液相色谱-质谱联用分析(LC-MS/MS)
采用纳流液相色谱(nanoLC)与高分辨率质谱(如Orbitrap、Q Exactive)联用,可实现修饰肽段的分离与鉴定。串联质谱(MS/MS)进一步对肽段碎片进行结构解析,实现修饰位点的精确定位。
4、数据分析与注释
修饰肽段的识别通常依赖MaxQuant、Proteome Discoverer等软件,结合Unimod数据库对修饰类型进行匹配。为提高可信度,研究者需设定严格的FDR(假发现率)阈值,并结合手动验证与生物学重复评估数据可靠性。
三、特定修饰类型的研究亮点
1、磷酸化蛋白质组学
磷酸化是研究最深入的PTM类型之一,在信号通路研究中应用广泛。高通量磷酸化组分析已成功揭示如EGFR、MAPK等关键通路的激活位点,在肿瘤靶点筛选中具有广泛应用。
2、泛素化和SUMO化
泛素化研究逐渐由蛋白降解功能拓展至信号调控与应激反应。近年来,小泛素样修饰(SUMOylation)因其在DNA修复和病毒感染过程中的重要性而受到关注,成为蛋白质稳态研究新热点。
3、糖基化与免疫相关机制
糖基化修饰在细胞识别和免疫逃逸中的角色尤为关键,N-糖基化与O-糖基化异常被证实与癌症免疫抑制机制密切相关。MS结合糖谱分析为抗体药物优化和生物制剂纯化提供重要支撑。
蛋白质翻译后修饰研究正从“蛋白质功能注解的补充”上升为“细胞调控研究的核心”,是理解复杂生命现象不可或缺的一环。无论是信号通路构建、疾病标志物筛选,还是药物靶点发现,PTM分析都提供了不可替代的视角。而要高效开展PTM研究,不仅需要强大的实验平台,更离不开标准化、系统化的技术服务支持。百泰派克生物科技依托丰富的质谱分析经验与全面的蛋白质组学解决方案,致力于为科研工作者提供高质量的翻译后修饰蛋白组分析服务,助力揭示细胞调控的核心机制,加速科研成果转化。
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