从原理到应用:PRM技术的全解析

    在蛋白质组学研究中,如何实现对特定蛋白或肽段的精准、稳定、可重复定量,一直是科学家关注的焦点。平行反应监测(Parallel Reaction Monitoring)PRM技术作为一种高特异性、高灵敏度、高通量的靶向质谱技术,正在逐步取代的SRM/MRM方法,广泛应用于生物标志物验证、临床研究、药物开发等多个前沿领域。本文将从PRM的原理讲起,系统解析其技术优势,并探讨其在科研与临床中的实际应用场景,同时介绍百泰派克生物科技如何通过PRM平台助力精准蛋白质定量研究。

     

    一、什么是PRM技术?

    PRM是一种基于高分辨率质谱仪(如Orbitrap)的靶向定量技术,属于选择性反应监测(SRM)/MRM的升级版,但采用完全不同的检测策略:

    1、工作流程:

    (1)在液相色谱-质谱联用系统中,选定目标肽段(Precursor Ion)

    (2)通过四极杆选择进入的母离子

    (3)进入HCD碰撞池产生碎片

    (4)使用Orbitrap分析器对所有碎片离子进行高分辨全扫描(Full MS/MS)

     

    2、核心优势:

    (1)无需预设碎片通道(transition),数据更全面

    (2)高分辨率、高精度,有效降低背景干扰

    (3)后期可重新提取其他碎片信息,具有数据重挖掘能力

    (4)支持更复杂样本背景中的靶标检测

     

    二、PRM技术与SRM/MRM的对比

     

    prm-quantitative-proteomics-zh1-1

     

    PRM适合在前期发现阶段(如DDA或DIA)筛选出候选靶标后,用于小规模样本的精准验证与定量分析。

     

    三、PRM技术的核心应用场景

    1、生物标志物验证

    在非靶向蛋白组学发现潜在差异蛋白后,PRM可用于对这些候选蛋白进行准确、可靠的定量验证,是转化研究不可或缺的一环。例如:

    (1)肿瘤早筛标志物定量验证

    (2)自身免疫疾病分型蛋白评估

    (3)药物反应相关蛋白验证

     

    2、临床样本蛋白定量分析

    PRM技术可适用于低丰度蛋白的检测,且受基质效应影响小,特别适合用于:

    (1)血浆/血清/脑脊液等复杂体液分析

    (2)小体积临床样本高置信度定量

    (3)多靶标并行定量(可同时定量10~50个蛋白)

     

    3、信号通路或蛋白网络的功能验证

    结合蛋白互作网络,选择特定路径中的多个关键蛋白,进行靶向定量追踪,用于研究:

    (1)通路激活/抑制机制

    (2)上下游调控关系验证

    (3)干预措施对蛋白表达的影响

     

    4、多组学整合中的蛋白验证环节

    在转录组、代谢组发现潜在靶点后,通过PRM进行跨组学数据验证,提高研究可靠性。

     

    四、PRM实验设计要点

    1、肽段筛选:选取唯一、稳定、适合离子化的特异肽段

    2、内标选择:推荐使用稳定同位素标记肽段(SIS)提高定量精度

    3、质谱参数优化:设置最佳碰撞能、离子灌注时间、扫描范围

    4、数据分析:常用软件包括Skyline、SpectroDive、Xcalibur等

    百泰派克提供从靶标设计、方法开发到数据分析的全流程PRM技术服务,支持多种样本类型与复杂背景。

     

    百泰派克生物科技使用Thermo Orbitrap Fusion Lumos/Exploris 480,实现高通量、高分辨PRM检测,可定量20~100个靶标蛋白,CV值稳定<15%。提供稳定同位素内标合成+方法验证+数据分析一站式服务,项目周期短,适配科研与临床验证需求,可提供原始数据+可视化报告+图表支持项目发表/专利申请。PRM以其高特异性、高通量、高重现性的特性,正在逐步成为蛋白质组学验证环节的主力技术。无论是在基础研究、转化医学,还是新药开发领域,PRM技术都展现出强大的应用潜力。百泰派克生物科技将持续优化PRM平台性能,为广大科研人员提供更可靠、更高效的靶向蛋白定量解决方案。

     

    百泰派克生物科技——生物制品表征,多组学生物质谱检测优质服务商

     

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