磷酸化组学分析技术

    磷酸化蛋白质组(Phosphoproteome)就是蛋白质组中全部的磷酸化蛋白质,而磷酸化蛋白质组学(Phosphoproteomics)就是针对磷酸化蛋白质的全面分析,包括对磷酸化的定性、定位和定量。

     

    磷酸化蛋白质组学分析技术主要与质谱技术相结合进行分析,分析流程包括样品中提取蛋并酶解成肽段,之后利用固定金属离子亲和色谱法(IMAC)、二氧化钛亲和色谱法(TiO2)等方法富集磷酸化肽段,最后联合质谱检测技术进行分析。

     

    常用的质谱定量磷酸化蛋白质组学分析技术主要包括TMT(Tandem Mass Tag),LFQ(Label Free Quantitation)和DIA(Data Independent Acquisition)技术。

     

    TMT定量:TMT是添加同位素标记的一种定量技术,TMT除了可以应用在全蛋白质组的鉴定以外,也可以用于磷酸化蛋白质组学分析。目前经过后期改进,TMT技术最多能同时对16个样品进行标记分析,消除多批次标记不平行问题,进一步减少定量数据丢失,准确性高。

     

    LFQ非标记定量:LFQ磷酸化蛋白质组学,其利用基于质谱的非标记定量技术研究磷酸化蛋白质组,可实现磷酸化蛋白质组的定性和定量鉴定。LFQ和TMT标记定量相比,非标记定量操作简单,样品损失小,单次实验可定量到的蛋白数目更多。但由于非标记定量依据一级谱图的峰强度或者峰面积,所以数据质量是关键,严重依赖于质谱仪的稳定性。

     

    DIA:DIA数据非依赖采集模式,是一种质谱分析中使用的数据采集模式,由于DIA数据采集窗口更宽,谱图更为复杂,想要在混合的谱图中正确定位磷酸化位点并且正确处理磷酸肽位置异构体,对谱图处理能力需要达到更高的要求。

     

    百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF质谱平台,Orbitrap Fusion质谱平台,Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC,推出磷酸化定量蛋白组分析服务技术包裹。只需要将您的实验目的告诉我们并寄送样品,百泰派克生物科技负责项目后续,包括蛋白提取、蛋白酶切、磷酸化肽段富集、肽段分离、质谱分析、质谱原始数据分析、生物信息学分析所有事宜。

     

    相关服务:

    多通路磷酸化蛋白质组学 

    翻译后修饰蛋白组分析 

    组蛋白翻译后修饰分析 

    定量蛋白组分析 

    靶向蛋白质组学

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