蛋白互作筛选
蛋白质相互作用(蛋白互作)在细胞的生理和病理过程中扮演着关键角色。了解蛋白质之间的相互作用对于揭示细胞信号传导路径、蛋白质功能以及疾病机制至关重要。蛋白质互作筛选是指使用各种技术和方法来识别蛋白质之间的相互作用伙伴。以下是几种常用的蛋白质互作筛选技术:
一、酵母双杂交系统(Yeast Two-Hybrid, Y2H)
原理:基于酵母转录因子的活性依赖于两个分离的域(DNA结合域和激活域)的重新组合。如果两个蛋白质相互作用,它们将这两个域带到一起,启动报告基因的表达。
应用:用于筛选未知的蛋白质-蛋白质相互作用。
二、共沉淀(Co-immunoprecipitation, Co-IP)
原理:利用抗体特异性结合目标蛋白,然后通过沉淀将其从样品中分离出来。与目标蛋白相互作用的蛋白也会被共同沉淀。
应用:验证已知蛋白质间的相互作用。
三、荧光共振能量转移(Förster Resonance Energy Transfer, FRET)
原理:基于两个荧光标记分子之间的能量转移,当它们距离非常近(1-10纳米)时,可以通过光谱分析检测到这种能量转移。
应用:实时观察活细胞内蛋白质间的相互作用。
四、 双分子荧光互补(Bimolecular Fluorescence Complementation, BiFC)
原理:将两个蛋白质分别与两个荧光蛋白的非活性片段融合。当这两个蛋白质相互作用时,两个荧光蛋白片段会聚合形成一个完整的荧光蛋白,发出荧光。
应用:在活细胞中检测蛋白质-蛋白质相互作用。
五、 质谱分析(Mass Spectrometry, MS)
原理:通过共沉淀或其他方法富集蛋白复合物,然后用质谱分析来鉴定这些复合物中的蛋白质。
应用:高通量鉴定蛋白质复合物的组成。
六、蛋白质芯片(Protein Arrays)
原理:在固体支持物上固定大量不同的纯化蛋白质,然后用标记的蛋白质或抗体探测与这些固定蛋白的相互作用。
应用:高通量筛选蛋白质-蛋白质、蛋白质-DNA/RNA、蛋白质-小分子相互作用。
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