定量蛋白质组学技术（二）

引言：为什么需要定量蛋白质组学？

在现代生命科学研究中，仅仅知道蛋白质的存在已远远不够。科学家更关注的是：这些蛋白表达多少？变化趋势如何？是否参与疾病发生？这就需要定量蛋白质组学（Quantitative Proteomics）技术的加持。定量蛋白质组学不仅能够全面识别样本中的蛋白质种类，更能精准测量它们的表达水平，是解析信号通路、发现生物标志物、研究疾病机制的关键利器。

 

一、定量蛋白质组学技术三大路线

1、标记法（Labeling-based Quantification）

TMT（Tandem Mass Tags）/iTRAQ等同位素标记技术，通过在蛋白或肽段上引入标签，实现多个样本的相对定量分析。

优势：

• 多重样本并行分析（常见6-16通道）

• 实验重复性高、数据一致性强

百泰派克生物科技在TMT/iTRAQ平台上优化了样本前处理与归一化流程，显著提升低丰度蛋白的检测率。

 

2、无标记法（Label-free Quantification）

通过MS信号强度（MS1）或肽段计数进行相对定量，不依赖于外源标签。

优势：

• 无需额外标记，适合样本数量多或来源受限的研究

• 灵活适配复杂样本（如组织、血清、细胞等）

百泰派克生物科技结合高分辨率Orbitrap质谱和先进算法，实现低CV值的LFQ定量，适配大队列临床样本分析。

 

3、绝对定量（Absolute Quantification）

例如AQUA、PRM、MRM等技术，通过合成同位素内标对目标蛋白进行精确定量。

优势：

• 获得准确的蛋白浓度值（ng/mL级）

• 适合生物标志物验证、药效评价、质量控制等环节

在靶向蛋白验证方面，百泰派克提供一站式PRM方法开发与数据解读服务，助力临床转化研究。

 

二、定量蛋白质组学的核心应用场景

1、差异表达分析

通过比较不同组（如疾病组与正常组）的蛋白表达差异，揭示潜在的发病机制与调控网络。

 

2、生物标志物筛选与验证

配合PRM/MRM等技术，可将筛选得到的候选蛋白进一步精确定量，用于早期诊断与靶点开发。

 

3、药物作用机制研究

监测药物干预前后的蛋白表达变化，解析其对代谢通路、信号网络的调控效应。

 

4、多组学联合分析

结合转录组、代谢组等，构建系统生物学视角下的疾病模型，推动精准医学研究。

百泰派克已完成数百例多组学联合项目，涵盖肿瘤、自身免疫、代谢性疾病等多个领域。

 

三、定量蛋白质组学技术发展趋势与挑战

1、高通量与高灵敏的需求不断提升

随着单细胞、类器官等新型模型兴起，对定量技术提出更高要求。

 

2、数据分析成为瓶颈

复杂的大数据需要强大的生信分析能力与AI算法辅助。百泰派克配备专业的生信团队，构建标准化数据处理与可视化报告系统，提升结果可解释性。

 

3、标准化与可重复性成为热点

定量实验流程的标准化、QC体系的建立，将直接影响科研成果的可信度与临床可转化性。

 

定量蛋白质组学技术正不断推动生物医学研究向更高维度迈进。从基础机制探索，到临床标志物验证，再到药物作用机制解析，它无疑是贯穿“从发现到应用”的核心桥梁。百泰派克生物科技深耕质谱平台十余年，依托高端仪器与成熟的定量流程，为科研与产业客户提供高质量、可发表的定量蛋白组服务。我们致力于让每一份样本数据，都为科研突破和产业转化提供真实而有力的证据。

 

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