蛋白泛素化怎么检测
泛素化修饰是蛋白翻译后的一种修饰方式,指小分子多肽泛素(Ubiquitin, Ub)在相关酶的作用下通过共价键连接在底物蛋白或目标蛋白上的过程。泛素化修饰主要介导蛋白质发生降解,但随着蛋白泛素化修饰的深入研究,人们发现泛素化修饰还可以参与调节其他的生命活动,例如细胞周期、转录激活、基因沉默以及免疫应答等。
那么如何检测靶蛋白是否发生了泛素化修饰呢?
蛋白质泛素化修饰检测的内容包括样品蛋白质是否发生泛素化、发生何种泛素化以及有多少蛋白质发生泛素化等。目前,蛋白泛素化检测的方法主要有基于特异抗体和基于质谱的两种鉴定方法。
基于特异抗体的方法如染色质免疫共沉淀、Western免疫印迹等,其基本原理相似,都是将样品蛋白进行提取、纯化、分离,再与抗体进行特异性结合并进行显色拍照,最后分析蛋白质泛素化的情况。
由于正常生理状态下蛋白质泛素化的程度较低,在利用质谱方法进行鉴定前,通常要将样品蛋白进行酶解,再用特异性识别抗体对泛素化的蛋白进行富集,然后进行质谱分析,最后对质谱数据进行数据库比对分析和生物信息学分析来定性和定量鉴定蛋白泛素化。
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