Olink中的蛋白归一化表达是什么
Proximity Extension Assay (PEA) 是Olink的核心技术平台，其原理是利用两种标记的寡核苷酸探针，探针在结合目标蛋白后会靠近并能通过PCR扩增进行检测，能检测低浓度蛋白质，并降低非特异性信号干扰。Olink中的蛋白归一化表达是其数据分析的环节。
归一化表达（Normalization expression）通常也被称为均一化表达，它们指的是在数据分析过程中，为了消除数据单位和量级的影响，使得数据更适合进行综合分析和比较，而将数据转换到同一尺度或者同一范围的方法。Olink中的蛋白归一化表达可以有效提高数据比较的准确性和科学性。
在生物信息学领域，尤其是基因表达数据分析中，归一化是一个非常关键的步骤。例如，在处理高通量测序数据（如RNA-seq）时，原始计数数据会受到测序深度、基因长度等因素的影响，通过归一化处理可以得到相对表达量，从而更准确地比较不同样本之间的基因表达水平。Olink中的蛋白归一化表达在类似情境中提供了重要的分析基础。
常见的归一化方法包括：
1.TPM（Transcripts Per Million）：每百万转录本数，用于RNA-seq数据的归一化，考虑了测序深度和基因长度。
2.FPKM（Fragments Per Kilobase of transcript per Million mapped reads）：每千个碱基的转录每百万映射读取的片段数，同样用于RNA-seq数据。
3.Z-score标准化：将数据转换为均值为0，标准差为1的形式。
4.Min-Max标准化：将数据缩放到一个固定的范围，通常是0到1。
Olink中的蛋白归一化表达使用了基于NPX（Normalized Protein eXpression）的归一化方法，可以在不同样本或实验条件下进行数据的可靠比较。
Olink使用NPX（Normalized Protein eXpression）均一化蛋白表达作为相对定量的单位。在 qPCR 中，反应曲线与阈值线相交点的x 轴值被称为 Ct，或“循环阈值”。这表明信号超过荧光信号阈值线所需的周期数。Olink借助一系列计算，将qPCR的Ct值转化成相对定量单位，即NPX。
NPX作为一个相对定量单位，其与蛋白质浓度呈对数关系。即使两个不同的蛋白质具有相同的 NPX 值，它们的绝对浓度也可能不同。Olink中的蛋白归一化表达需要注意在单次运行的样本之间分别对每项测定的NPX进行比较。在没有进行适当的板间归一化的情况下，不应比较NPX，因为有可能将运行中的中位值变化错误地解释为生物学差异。简而言之，不同分析项目之间没有桥接样本，则不能进行比较，而相同项目不同蛋白之间也不能进行比较。同一个项目同一个蛋白在不同样本之间的差异，利用NPX的相对差异可以更容易地进行比较，且通常不需要额外的标准化步骤。通过这种方式，Olink中的蛋白归一化表达实现了精确和高效的生物信息解读。
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