Sanger测序与Edman测序的区别是什么

    Sanger测序与Edman测序在多个方面存在显著的区别,以下是两者的对比分析:

     

    一、测序对象

    Sanger测序:主要用于DNA分子的测序,是确定核酸中核苷酸序列的一种方法。

    Edman测序:主要用于蛋白质的测序,特别是蛋白质的N-末端序列分析。

     

    二、测序原理

    Sanger测序:基于双脱氧链终止法,利用DNA聚合酶延伸结合在待定序列模板上的引物,直到掺入一种链终止核苷酸为止。由于双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)缺乏延伸所需要的3-OH基团,使延长的寡聚核苷酸选择性地在特定碱基处终止。通过高分辨率变性凝胶电泳分离不同长度的片段,进而确定DNA的碱基序列。

    Edman测序:属于化学降解法,通过反复循环的化学反应,每次从蛋白质或多肽的N-末端去除一个氨基酸残基,并对其进行鉴定,从而逐步确定整个蛋白质的氨基酸序列。

     

    三、测序产物与检测

    Sanger测序:产物是具有共同起始点但终止在不同核苷酸上的不同长度DNA片段。这些片段通过尿素变性的PAGE胶上电泳进行检测,从而获得可见DNA碱基序列。

    Edman测序:产物是每次循环中从蛋白质N-末端去除的氨基酸残基。这些残基通常通过色谱分析(如液相色谱)进行分离和鉴定。

     

    四、测序长度与限制

    Sanger测序:理论上可以测定较长的DNA序列,但实际操作中受到测序引物设计、测序反应条件等因素的影响。对于未知序列,需要先构建克隆后才能测序,难以实现基因组水平的大规模测序。

    Edman测序:通常用于测定蛋白质N-末端的较短序列(一般不超过40个氨基酸残基)。对于N-末端封闭或修饰后的氨基酸残基,Edman测序可能无法准确测定。此外,随着检测氨基酸数量的增加,测序质量可能会下降。

     

    五、应用与优势

    Sanger测序:适用于已知序列的验证测序、文库筛选、克隆鉴定、PCR重测序等。其优点是测序结果直观、便于分析。

    Edman测序:作为蛋白质N-末端测序的主要方法之一,Edman测序不需要借助蛋白数据库便可以直接进行序列分析。其关键优势是结果直观且可以直接得到氨基酸序列。

     

    Sanger测序与Edman测序在测序对象、测序原理、测序产物与检测、测序长度与限制以及应用与优势等方面均存在显著差异。选择哪种测序方法取决于具体的实验需求和目标。

     

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    相关服务:

    基于Edman降解的蛋白质N端测序

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