靶向蛋白质组学和发现蛋白质组学的区别和特点

蛋白质组学研究策略可分为发现蛋白质组学和靶向蛋白质组学。发现蛋白质组学更关注蛋白质筛选和动力学,而靶向蛋白质组学更侧重于检测目标蛋白质/多肽以实现绝对定量。

靶向蛋白质组学分析策略

SRM/MRM通过两阶段离子选择消除了多数干扰离子。质谱的化学干扰降低,显着提高了目标检测器的信噪比,从而实现了高检测灵敏度。

PRM可以在一小时内同时定量50种蛋白质,而无需使用抗体。也无需选择离子对和优化碎片能量,即可轻松完成产物离子的全面扫描。PRM可以从目标离子对碎片检测转换中检所有目标离子,从而减少工作量,并使得分辨率更高。

相关服务

MRM/PRM定量蛋白组学

靶向蛋白质组学应用

1. 靶向蛋白质组学用于深入分析和定量测定生物样品中所选蛋白质。
2. 用作单克隆抗体(mAb)剂量药代动力学(PK)领域中配体结合测定(ligand binding assay,LBA)的辅助工具。
3. 系统生物学和临床蛋白质组学研究。
4. 预测转运蛋白介导的药物清除,并促进新药研发。

发现蛋白质组学分析策略

SWATH-DIA适用于高通量大规模蛋白质定量分析。MS1前体离子和MS2碎片离子的峰信息非常完整,需要进行回顾性分析。无需分组即可轻松操作。SWATH-DIA定量肽的数量已大大增加,增加了相应可定量蛋白质的数量和检测到的蛋白质的序列覆盖率。

在MSX-DIA中,质量范围分为更窄的前驱物隔离窗口,每个窗口通常约宽4 m/z,可以收集所有离子和碎片光谱,而不会丢失任何信息。数据更易于跟踪,即使无法以当前水平找到某些蛋白质或化合物,也可以在后面追溯它们。

发现蛋白质组学的目的是收集有关生物样品中所有蛋白质和蛋白质结构的信息。利用样本上获取的信息,发现蛋白质组学可以在一个实验中鉴定出数千种蛋白质和蛋白质结构。

相关服务

SWATH定量蛋白组学

发现蛋白质组学应用

1.宿主细胞蛋白质分析;
2.化学修饰分析;
3.生物标志物发现;
4.药物靶标发现。

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